RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeastyeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDR2YOL052C-A SNT2P53127 1403 aa16.44■□□□□ 0.22
DDR2YOL052C-A MET5P47169 1442 aa16.42■□□□□ 0.22
DDR2YOL052C-A PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
DDR2YOL052C-A NTE1Q04958 1679 aa16.4■□□□□ 0.22
DDR2YOL052C-A ULS1Q08562 1619 aa16.38■□□□□ 0.21
DDR2YOL052C-A RPO21P04050 1733 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
DDR2YOL052C-A NUP159P40477 1460 aa16.33■□□□□ 0.2
DDR2YOL052C-A RTT106P40161 455 aa16.29■□□□□ 0.2
DDR2YOL052C-A GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
DDR2YOL052C-A GEA2P39993 1459 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
DDR2YOL052C-A IFH1P39520 1085 aa16.26■□□□□ 0.19
DDR2YOL052C-A YRF1-1P0CX20 1796 aa16.24■□□□□ 0.19
DDR2YOL052C-A YRF1-5P0CX21 1796 aa16.24■□□□□ 0.19
DDR2YOL052C-A YRF1-8P0CX22 1796 aa16.24■□□□□ 0.19
DDR2YOL052C-A MET10P39692 1035 aa16.17■□□□□ 0.18
DDR2YOL052C-A IRC20Q06554 1556 aa16.17■□□□□ 0.18
DDR2YOL052C-A VPS15P22219 1454 aa16.12■□□□□ 0.17
DDR2YOL052C-A PDR12Q02785 1511 aa16.12■□□□□ 0.17
DDR2YOL052C-A IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
DDR2YOL052C-A CAT8P39113 1433 aa16.09■□□□□ 0.17
DDR2YOL052C-A TY3B-GQ99315 1547 aa16.08■□□□□ 0.16
DDR2YOL052C-A SPO14P36126 1683 aa16.05■□□□□ 0.16
DDR2YOL052C-A LTE1P07866 1435 aa16.05■□□□□ 0.16
DDR2YOL052C-A YBT1P32386 1661 aa16.05■□□□□ 0.16
DDR2YOL052C-A GDB1Q06625 1536 aa16.01■□□□□ 0.15
DDR2YOL052C-A NUP170P38181 1502 aa16■□□□□ 0.15
DDR2YOL052C-A PDR10P51533 1564 aa15.97■□□□□ 0.15
DDR2YOL052C-A NUP157P40064 1391 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
DDR2YOL052C-A BUD3P25558 1636 aa15.86■□□□□ 0.13
DDR2YOL052C-A ARO1P08566 1588 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
DDR2YOL052C-A IQG1Q12280 1495 aa15.85■□□□□ 0.13
DDR2YOL052C-A SSM4P40318 1319 aa15.84■□□□□ 0.13
DDR2YOL052C-A CKB1P43639 278 aa15.82■□□□□ 0.12
DDR2YOL052C-A SRB8P25648 1427 aa15.81■□□□□ 0.12
DDR2YOL052C-A DRS2P39524 1355 aa15.79■□□□□ 0.12
DDR2YOL052C-A SEC7P11075 2009 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
DDR2YOL052C-A BNI1P41832 1953 aa15.75■□□□□ 0.11
DDR2YOL052C-A YSP2Q06681 1438 aa15.74■□□□□ 0.11
DDR2YOL052C-A ITT1Q04638 464 aa15.71■□□□□ 0.11
DDR2YOL052C-A MMS1Q06211 1407 aa15.69■□□□□ 0.1
DDR2YOL052C-A DOP1Q03921 1698 aa15.69■□□□□ 0.1
DDR2YOL052C-A TRM3Q07527 1436 aa15.68■□□□□ 0.1
DDR2YOL052C-A BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
DDR2YOL052C-A BNR1P40450 1375 aa15.62■□□□□ 0.09
DDR2YOL052C-A CHC1P22137 1653 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
DDR2YOL052C-A GCN2P15442 1659 aa15.53■□□□□ 0.08
DDR2YOL052C-A DNF2Q12675 1612 aa15.37■□□□□ 0.05
DDR2YOL052C-A URN1Q06525 465 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
DDR2YOL052C-A YOR093CQ12275 1648 aa15.32■□□□□ 0.04
DDR2YOL052C-A NUP188P52593 1655 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
DDR2YOL052C-A PDR5P33302 1511 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
DDR2YOL052C-A PAF1P38351 445 aa15.28■□□□□ 0.04
DDR2YOL052C-A VMR1P38735 1592 aa15.24■□□□□ 0.03
DDR2YOL052C-A YAP3P38749 330 aa15.23■□□□□ 0.03
DDR2YOL052C-A NOP7P53261 605 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
DDR2YOL052C-A IML1P47170 1584 aa15.19■□□□□ 0.02
DDR2YOL052C-A IPL1P38991 367 aa15.19■□□□□ 0.02
DDR2YOL052C-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
DDR2YOL052C-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
DDR2YOL052C-A RAV1P47104 1357 aa15.15■□□□□ 0.02
DDR2YOL052C-A PDR11P40550 1411 aa15.14■□□□□ 0.01
DDR2YOL052C-A HAP1P0CE41 1502 aa15.1■□□□□ 0.01
DDR2YOL052C-A RTC1Q08281 1341 aa15.1■□□□□ 0.01
DDR2YOL052C-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
DDR2YOL052C-A DNF3Q12674 1656 aa15.07■□□□□ 0
DDR2YOL052C-A POL5P39985 1022 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
DDR2YOL052C-A ESL2P36168 1195 aa14.94□□□□□ -0.02
DDR2YOL052C-A MAK10Q02197 733 aa14.92□□□□□ -0.02
DDR2YOL052C-A NUP192P47054 1683 aa14.92□□□□□ -0.02
DDR2YOL052C-A TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
DDR2YOL052C-A TAF5P38129 798 aa14.86□□□□□ -0.03
DDR2YOL052C-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
DDR2YOL052C-A BCK1Q01389 1478 aa14.82□□□□□ -0.04
DDR2YOL052C-A MIF2P35201 549 aa14.82□□□□□ -0.04
DDR2YOL052C-A SCT1P32784 759 aa14.8□□□□□ -0.04
DDR2YOL052C-A RAD9P14737 1309 aa14.77□□□□□ -0.04
DDR2YOL052C-A MRX12P47084 519 aa14.77□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A NAP1P25293 417 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A KIP3P53086 805 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A ORC1P54784 914 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A CAB1Q04430 367 aa14.74□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A USO1P25386 1790 aa14.73□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A TAF8Q03750 510 aa14.71□□□□□ -0.05
DDR2YOL052C-A SPE2P21182 396 aa14.7□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A KRE5P22023 1365 aa14.7□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A MHP1P43638 1398 aa14.69□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A RIA1P53893 1110 aa14.67□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A YMR196WQ04336 1088 aa14.65□□□□□ -0.06
DDR2YOL052C-A SEC3P33332 1336 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
DDR2YOL052C-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DDR2YOL052C-A MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
DDR2YOL052C-A CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
DDR2YOL052C-A PDS5Q04264 1277 aa14.55□□□□□ -0.08
DDR2YOL052C-A THI12P42883 340 aa14.47□□□□□ -0.09
DDR2YOL052C-A THI5P43534 340 aa14.47□□□□□ -0.09
DDR2YOL052C-A THI11P47183 340 aa14.47□□□□□ -0.09
DDR2YOL052C-A RCM1P53972 490 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms