RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2YOL007C RAM2P29703 316 aa9.25□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C PTC4P38089 393 aa9.25□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C YDL129WQ07555 291 aa9.24□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C MIF2P35201 549 aa9.22□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CSI2YOL007C EDS1P38073 919 aa9.19□□□□□ -0.94
CSI2YOL007C PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CSI2YOL007C ATH1P48016 1211 aa9.14□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C GUT1P32190 709 aa9.12□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C PRE3P38624 215 aa9.12□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C COQ8P27697 501 aa9.1□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C BCK2P33306 851 aa9.09□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C PML39Q03760 334 aa9.09□□□□□ -0.95
CSI2YOL007C YDR344CQ05510 147 aa9.08□□□□□ -0.96
CSI2YOL007C NST1P53935 1240 aa9.06□□□□□ -0.96
CSI2YOL007C SOL3P38858 249 aa9.03□□□□□ -0.96
CSI2YOL007C MID1P41821 548 aa8.99□□□□□ -0.97
CSI2YOL007C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CSI2YOL007C MPH3P0CE00 602 aa8.95□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C AI4P03878 556 aa8.94□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C VRP1P37370 817 aa8.93□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C ARH1P48360 493 aa8.93□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CSI2YOL007C YGR273CP53329 174 aa8.88□□□□□ -0.99
CSI2YOL007C PEX29Q03370 554 aa8.88□□□□□ -0.99
CSI2YOL007C XDJ1P39102 459 aa8.87□□□□□ -0.99
CSI2YOL007C SPT23P35210 1082 aa8.82□□□□□ -1
CSI2YOL007C HAP5Q02516 242 aa8.81□□□□□ -1
CSI2YOL007C MPC54Q08550 464 aa8.79□□□□□ -1
CSI2YOL007C SLI15P38283 698 aa8.76□□□□□ -1.01
CSI2YOL007C BNI4P53858 892 aa8.75□□□□□ -1.01
CSI2YOL007C NMA111P53920 997 aa8.72□□□□□ -1.01
CSI2YOL007C SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C KEX1P09620 729 aa8.7□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C DPL1Q05567 589 aa8.69□□□□□ -1.02
CSI2YOL007C UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CSI2YOL007C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CSI2YOL007C VHR2P40041 505 aa8.61□□□□□ -1.03
CSI2YOL007C CDC73Q06697 393 aa8.6□□□□□ -1.03
CSI2YOL007C YPR015CQ12531 247 aa8.59□□□□□ -1.03
CSI2YOL007C ISU2Q12056 156 aa8.58□□□□□ -1.04
CSI2YOL007C RAM1P22007 431 aa8.56□□□□□ -1.04
CSI2YOL007C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.56□□□□□ -1.04not detected
CSI2YOL007C RAD54P32863 898 aa8.52□□□□□ -1.05
CSI2YOL007C SRC1Q03707 834 aa8.52□□□□□ -1.05
CSI2YOL007C PDR1P12383 1068 aa8.5□□□□□ -1.05
CSI2YOL007C RAS1P01119 309 aa8.46□□□□□ -1.06
CSI2YOL007C YDR090CQ03193 310 aa8.46□□□□□ -1.06
CSI2YOL007C GYP1Q08484 637 aa8.44□□□□□ -1.06
CSI2YOL007C IFH1P39520 1085 aa8.43□□□□□ -1.06
CSI2YOL007C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CSI2YOL007C KIC1P38692 1080 aa8.39□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C YPR148CQ06523 435 aa8.39□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C SDH2P21801 266 aa8.37□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C AMS1P22855 1083 aa8.35□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C SAS4Q04003 481 aa8.35□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C YRR1Q12172 810 aa8.35□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CSI2YOL007C PEX21P50091 288 aa8.33□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C VPS70P47161 811 aa8.3□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C CSC1Q06538 782 aa8.3□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C STR2P47164 639 aa8.29□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C TFB4Q12004 338 aa8.29□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C ORC6P38826 435 aa8.28□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CSI2YOL007C ISM1P48526 1002 aa8.27□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C NUD1P32336 851 aa8.25□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.25□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C TRK1P12685 1235 aa8.24□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C COX6P00427 148 aa8.22□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CSI2YOL007C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C NPL4P33755 580 aa8.18□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-DR4O74302 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-AP0CX57 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-ORP0CX59 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-JR2P47099 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-DR1Q03856 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-BRQ12217 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-NL2Q12470 440 aa8.17□□□□□ -1.1
CSI2YOL007C TY1A-GR2Q12485 440 aa8.17□□□□□ -1.1
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