RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
YHL009W-AYHL009W-A HTA2P04912 132 aa9.61□□□□□ -0.87
YHL009W-AYHL009W-A PTC4P38089 393 aa9.6□□□□□ -0.87
YHL009W-AYHL009W-A XDJ1P39102 459 aa9.6□□□□□ -0.87
YHL009W-AYHL009W-A YEL023CP39992 682 aa9.57□□□□□ -0.88
YHL009W-AYHL009W-A DCW1P36091 449 aa9.53□□□□□ -0.88
YHL009W-AYHL009W-A VRP1P37370 817 aa9.53□□□□□ -0.88
YHL009W-AYHL009W-A YDR344CQ05510 147 aa9.48□□□□□ -0.89
YHL009W-AYHL009W-A RGA2Q06407 1009 aa9.48□□□□□ -0.89
YHL009W-AYHL009W-A DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
YHL009W-AYHL009W-A PML39Q03760 334 aa9.39□□□□□ -0.91
YHL009W-AYHL009W-A ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
YHL009W-AYHL009W-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YHL009W-AYHL009W-A ARH1P48360 493 aa9.34□□□□□ -0.91
YHL009W-AYHL009W-A MIF2P35201 549 aa9.32□□□□□ -0.92
YHL009W-AYHL009W-A SRC1Q03707 834 aa9.3□□□□□ -0.92
YHL009W-AYHL009W-A ATH1P48016 1211 aa9.27□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A RGA1P39083 1007 aa9.26□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A RAM2P29703 316 aa9.23□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A GUT1P32190 709 aa9.23□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A NST1P53935 1240 aa9.23□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A SPT23P35210 1082 aa9.22□□□□□ -0.93
YHL009W-AYHL009W-A EDS1P38073 919 aa9.21□□□□□ -0.94
YHL009W-AYHL009W-A MID1P41821 548 aa9.2□□□□□ -0.94
YHL009W-AYHL009W-A COQ8P27697 501 aa9.14□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A BNI4P53858 892 aa9.11□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A HAP5Q02516 242 aa9.11□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A PEX29Q03370 554 aa9.1□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A AI4P03878 556 aa9.09□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A SOL3P38858 249 aa9.09□□□□□ -0.95
YHL009W-AYHL009W-A MPH3P0CE00 602 aa9.08□□□□□ -0.96
YHL009W-AYHL009W-A ILV3P39522 585 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YHL009W-AYHL009W-A PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
YHL009W-AYHL009W-A MPC54Q08550 464 aa8.97□□□□□ -0.97
YHL009W-AYHL009W-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YHL009W-AYHL009W-A YGR273CP53329 174 aa8.95□□□□□ -0.98
YHL009W-AYHL009W-A RAS1P01119 309 aa8.93□□□□□ -0.98
YHL009W-AYHL009W-A NMA111P53920 997 aa8.87□□□□□ -0.99
YHL009W-AYHL009W-A YPR015CQ12531 247 aa8.85□□□□□ -0.99
YHL009W-AYHL009W-A SLI15P38283 698 aa8.84□□□□□ -0.99
YHL009W-AYHL009W-A TRK1P12685 1235 aa8.82□□□□□ -1
YHL009W-AYHL009W-A RAM1P22007 431 aa8.81□□□□□ -1
YHL009W-AYHL009W-A DPL1Q05567 589 aa8.81□□□□□ -1
YHL009W-AYHL009W-A AMS1P22855 1083 aa8.79□□□□□ -1
YHL009W-AYHL009W-A KEX1P09620 729 aa8.74□□□□□ -1.01
YHL009W-AYHL009W-A ISU2Q12056 156 aa8.72□□□□□ -1.01
YHL009W-AYHL009W-A YPL062WQ02781 134 aa8.7□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A SDH2P21801 266 aa8.69□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A CDC73Q06697 393 aa8.68□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A GYP1Q08484 637 aa8.68□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A SAS4Q04003 481 aa8.65□□□□□ -1.02
YHL009W-AYHL009W-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YHL009W-AYHL009W-A VHR2P40041 505 aa8.62□□□□□ -1.03
YHL009W-AYHL009W-A YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
YHL009W-AYHL009W-A PDR1P12383 1068 aa8.58□□□□□ -1.04
YHL009W-AYHL009W-A PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.58□□□□□ -1.04not detected
YHL009W-AYHL009W-A RAD54P32863 898 aa8.57□□□□□ -1.04
YHL009W-AYHL009W-A YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.57□□□□□ -1.04
YHL009W-AYHL009W-A RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
YHL009W-AYHL009W-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
YHL009W-AYHL009W-A KIC1P38692 1080 aa8.46□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A BRE2P43132 505 aa8.45□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A PEX21P50091 288 aa8.45□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A YDR090CQ03193 310 aa8.43□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A YRR1Q12172 810 aa8.43□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A IFH1P39520 1085 aa8.42□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
YHL009W-AYHL009W-A AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A GCR2Q01722 534 aa8.36□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A CSC1Q06538 782 aa8.36□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A STR2P47164 639 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A TFB4Q12004 338 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL009W-AYHL009W-A ERG12P07277 443 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A ISM1P48526 1002 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A NPL4P33755 580 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A NUD1P32336 851 aa8.31□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A CST6P40535 587 aa8.31□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A CLA4P48562 842 aa8.31□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.3□□□□□ -1.08not detected
YHL009W-AYHL009W-A LAM6Q08001 693 aa8.28□□□□□ -1.08
YHL009W-AYHL009W-A GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A YPR148CQ06523 435 aa8.27□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A ORC6P38826 435 aa8.25□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A VPS70P47161 811 aa8.23□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A CDC4P07834 779 aa8.22□□□□□ -1.09
YHL009W-AYHL009W-A COX6P00427 148 aa8.21□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A MET22P32179 357 aa8.21□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A ENV9Q08651 330 aa8.21□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YHL009W-AYHL009W-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.5 ms