RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W SNT2P53127 1403 aa6.44□□□□□ -1.38
SPC105YGL093W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPC105YGL093W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SPC105YGL093W NUP159P40477 1460 aa6.43□□□□□ -1.38
SPC105YGL093W MLP2P40457 1679 aa6.41□□□□□ -1.38
SPC105YGL093W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W PDR12Q02785 1511 aa6.37□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W VPS15P22219 1454 aa6.37□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W YRF1-1P0CX20 1796 aa6.36□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W YRF1-5P0CX21 1796 aa6.36□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W YRF1-8P0CX22 1796 aa6.36□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W ULS1Q08562 1619 aa6.35□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W IRC20Q06554 1556 aa6.34□□□□□ -1.39
SPC105YGL093W MET10P39692 1035 aa6.33□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W CAT8P39113 1433 aa6.31□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W RTT106P40161 455 aa6.31□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W BUD3P25558 1636 aa6.31□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W GDB1Q06625 1536 aa6.29□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W DRS2P39524 1355 aa6.28□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W TRM3Q07527 1436 aa6.28□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SPC105YGL093W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W NUP170P38181 1502 aa6.27□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W SPO14P36126 1683 aa6.27□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W BNI1P41832 1953 aa6.26□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W IQG1Q12280 1495 aa6.25□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W PDR10P51533 1564 aa6.23□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W DOP1Q03921 1698 aa6.21□□□□□ -1.41
SPC105YGL093W YBT1P32386 1661 aa6.2□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W ITT1Q04638 464 aa6.2□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W TY3B-GQ99315 1547 aa6.2□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W MMS1Q06211 1407 aa6.19□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W IFH1P39520 1085 aa6.18□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SPC105YGL093W SRB8P25648 1427 aa6.14□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W YSP2Q06681 1438 aa6.13□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W DNF2Q12675 1612 aa6.12□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W BNR1P40450 1375 aa6.09□□□□□ -1.43
SPC105YGL093W URN1Q06525 465 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SPC105YGL093W HAP1P0CE41 1502 aa6.07□□□□□ -1.44
SPC105YGL093W CKB1P43639 278 aa6.06□□□□□ -1.44
SPC105YGL093W MIF2P35201 549 aa6.05□□□□□ -1.44
SPC105YGL093W ABP1P15891 592 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SPC105YGL093W YOR093CQ12275 1648 aa6.02□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W GCN2P15442 1659 aa6.01□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W YAP3P38749 330 aa5.99□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W SSM4P40318 1319 aa5.98□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W DNF3Q12674 1656 aa5.98□□□□□ -1.45
SPC105YGL093W IPL1P38991 367 aa5.92□□□□□ -1.46
SPC105YGL093W IML1P47170 1584 aa5.92□□□□□ -1.46
SPC105YGL093W VMR1P38735 1592 aa5.91□□□□□ -1.46
SPC105YGL093W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SPC105YGL093W PAF1P38351 445 aa5.89□□□□□ -1.47
SPC105YGL093W MAK10Q02197 733 aa5.88□□□□□ -1.47
SPC105YGL093W RAV1P47104 1357 aa5.87□□□□□ -1.47
SPC105YGL093W RTC1Q08281 1341 aa5.84□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W YMR196WQ04336 1088 aa5.83□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W PDR11P40550 1411 aa5.81□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W SCT1P32784 759 aa5.81□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W TYS1P36421 394 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W YFR006WP43590 535 aa5.79□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W BCK1Q01389 1478 aa5.79□□□□□ -1.48
SPC105YGL093W NUP192P47054 1683 aa5.76□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W NAP1P25293 417 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W ESL2P36168 1195 aa5.75□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W USO1P25386 1790 aa5.74□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W MRX12P47084 519 aa5.73□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SPC105YGL093W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W RIA1P53893 1110 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W KRE5P22023 1365 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W THI12P42883 340 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W THI5P43534 340 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W THI11P47183 340 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W THI13Q07748 340 aa5.67□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W RAD9P14737 1309 aa5.66□□□□□ -1.5
SPC105YGL093W CAB1Q04430 367 aa5.65□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W PSK1P31374 1356 aa5.63□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W TAF5P38129 798 aa5.63□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W TAF8Q03750 510 aa5.62□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W SPE2P21182 396 aa5.61□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W PTP3P40048 928 aa5.61□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W POL5P39985 1022 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
SPC105YGL093W CPS1P27614 576 aa5.59□□□□□ -1.52
SPC105YGL093W KIP3P53086 805 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
SPC105YGL093W MHP1P43638 1398 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.8 ms