RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W VTH2P40890 1549 aa13.84□□□□□ -0.19
DDI1YER143W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
DDI1YER143W TSC11P40061 1430 aa13.81□□□□□ -0.2
DDI1YER143W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
DDI1YER143W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
DDI1YER143W AVT3P36062 692 aa13.76□□□□□ -0.21
DDI1YER143W MLP2P40457 1679 aa13.73□□□□□ -0.21
DDI1YER143W NTE1Q04958 1679 aa13.72□□□□□ -0.21
DDI1YER143W ULS1Q08562 1619 aa13.72□□□□□ -0.21
DDI1YER143W TRM732Q03496 1420 aa13.71□□□□□ -0.22
DDI1YER143W SNT2P53127 1403 aa13.69□□□□□ -0.22
DDI1YER143W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
DDI1YER143W STH1P32597 1359 aa13.68□□□□□ -0.22
DDI1YER143W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
DDI1YER143W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
DDI1YER143W MET5P47169 1442 aa13.64□□□□□ -0.23
DDI1YER143W NUP159P40477 1460 aa13.59□□□□□ -0.23
DDI1YER143W YRF1-1P0CX20 1796 aa13.58□□□□□ -0.23
DDI1YER143W YRF1-5P0CX21 1796 aa13.58□□□□□ -0.23
DDI1YER143W YRF1-8P0CX22 1796 aa13.58□□□□□ -0.23
DDI1YER143W TAF7Q05021 590 aa13.54□□□□□ -0.24
DDI1YER143W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
DDI1YER143W IRC20Q06554 1556 aa13.52□□□□□ -0.25
DDI1YER143W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
DDI1YER143W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
DDI1YER143W TY3B-GQ99315 1547 aa13.48□□□□□ -0.25
DDI1YER143W PDR12Q02785 1511 aa13.43□□□□□ -0.26
DDI1YER143W YBT1P32386 1661 aa13.41□□□□□ -0.26
DDI1YER143W SPO14P36126 1683 aa13.41□□□□□ -0.26
DDI1YER143W VPS15P22219 1454 aa13.41□□□□□ -0.26
DDI1YER143W IFH1P39520 1085 aa13.37□□□□□ -0.27
DDI1YER143W NUP170P38181 1502 aa13.36□□□□□ -0.27
DDI1YER143W GDB1Q06625 1536 aa13.36□□□□□ -0.27
DDI1YER143W RTT106P40161 455 aa13.33□□□□□ -0.28
DDI1YER143W LTE1P07866 1435 aa13.32□□□□□ -0.28
DDI1YER143W PDR10P51533 1564 aa13.31□□□□□ -0.28
DDI1YER143W CAT8P39113 1433 aa13.3□□□□□ -0.28
DDI1YER143W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
DDI1YER143W MET10P39692 1035 aa13.29□□□□□ -0.28
DDI1YER143W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
DDI1YER143W MRPL32P25348 183 aa13.28□□□□□ -0.28
DDI1YER143W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
DDI1YER143W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
DDI1YER143W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
DDI1YER143W REB1P21538 810 aa13.23□□□□□ -0.29
DDI1YER143W BNI1P41832 1953 aa13.19□□□□□ -0.3
DDI1YER143W IQG1Q12280 1495 aa13.16□□□□□ -0.3
DDI1YER143W SSM4P40318 1319 aa13.13□□□□□ -0.31
DDI1YER143W BUD3P25558 1636 aa13.11□□□□□ -0.31
DDI1YER143W YSP2Q06681 1438 aa13.08□□□□□ -0.32
DDI1YER143W DRS2P39524 1355 aa13.07□□□□□ -0.32
DDI1YER143W SRB8P25648 1427 aa13.07□□□□□ -0.32
DDI1YER143W DOP1Q03921 1698 aa13.07□□□□□ -0.32
DDI1YER143W ITT1Q04638 464 aa13.02□□□□□ -0.33
DDI1YER143W TRM3Q07527 1436 aa13.02□□□□□ -0.33
DDI1YER143W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
DDI1YER143W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
DDI1YER143W YGL015CP33199 130 aa12.99□□□□□ -0.33
DDI1YER143W CKB1P43639 278 aa12.99□□□□□ -0.33
DDI1YER143W MMS1Q06211 1407 aa12.93□□□□□ -0.34
DDI1YER143W BNR1P40450 1375 aa12.89□□□□□ -0.35
DDI1YER143W GCN2P15442 1659 aa12.87□□□□□ -0.35
DDI1YER143W DNF2Q12675 1612 aa12.86□□□□□ -0.35
DDI1YER143W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
DDI1YER143W YOR093CQ12275 1648 aa12.79□□□□□ -0.36
DDI1YER143W VMR1P38735 1592 aa12.77□□□□□ -0.37
DDI1YER143W SPT21P35209 758 aa12.76□□□□□ -0.37
DDI1YER143W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
DDI1YER143W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
DDI1YER143W IML1P47170 1584 aa12.64□□□□□ -0.39
DDI1YER143W PDR11P40550 1411 aa12.62□□□□□ -0.39
DDI1YER143W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
DDI1YER143W CDC27P38042 758 aa12.6□□□□□ -0.39
DDI1YER143W DNF3Q12674 1656 aa12.59□□□□□ -0.39
DDI1YER143W HAP1P0CE41 1502 aa12.52□□□□□ -0.4
DDI1YER143W YAP3P38749 330 aa12.52□□□□□ -0.41
DDI1YER143W RAV1P47104 1357 aa12.51□□□□□ -0.41
DDI1YER143W IPL1P38991 367 aa12.5□□□□□ -0.41
DDI1YER143W URN1Q06525 465 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
DDI1YER143W ABP1P15891 592 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
DDI1YER143W TYS1P36421 394 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
DDI1YER143W NUP192P47054 1683 aa12.47□□□□□ -0.41
DDI1YER143W PAF1P38351 445 aa12.44□□□□□ -0.42
DDI1YER143W NOP7P53261 605 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
DDI1YER143W RTC1Q08281 1341 aa12.43□□□□□ -0.42
DDI1YER143W RIM101P33400 625 aa12.35□□□□□ -0.43
DDI1YER143W TFC8Q12308 588 aa12.35□□□□□ -0.43
DDI1YER143W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
DDI1YER143W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
DDI1YER143W HOP09932 586 aa12.3□□□□□ -0.44
DDI1YER143W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
DDI1YER143W BCK1Q01389 1478 aa12.29□□□□□ -0.44
DDI1YER143W MAK10Q02197 733 aa12.29□□□□□ -0.44
DDI1YER143W USO1P25386 1790 aa12.25□□□□□ -0.45
DDI1YER143W RAD9P14737 1309 aa12.22□□□□□ -0.45
DDI1YER143W DCD1P06773 312 aa12.22□□□□□ -0.45
DDI1YER143W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
DDI1YER143W MIF2P35201 549 aa12.21□□□□□ -0.45
DDI1YER143W MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
DDI1YER143W ESL2P36168 1195 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.2 ms