RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W GYP5Q12344 894 aa8.14□□□□□ -1.11
RTT105YER104W YEL023CP39992 682 aa8.1□□□□□ -1.11
RTT105YER104W DCW1P36091 449 aa8.07□□□□□ -1.12
RTT105YER104W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RTT105YER104W RGA1P39083 1007 aa8.03□□□□□ -1.12
RTT105YER104W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.03□□□□□ -1.12not detected
RTT105YER104W YDR344CQ05510 147 aa8.01□□□□□ -1.13
RTT105YER104W CST9Q06032 482 aa7.97□□□□□ -1.13
RTT105YER104W PML39Q03760 334 aa7.96□□□□□ -1.14
RTT105YER104W SRC1Q03707 834 aa7.93□□□□□ -1.14
RTT105YER104W SSP1P38871 571 aa7.91□□□□□ -1.14
RTT105YER104W RCR1P38212 213 aa7.9□□□□□ -1.14
RTT105YER104W ARH1P48360 493 aa7.9□□□□□ -1.14
RTT105YER104W MGA2P40578 1113 aa7.88□□□□□ -1.15
RTT105YER104W SPT23P35210 1082 aa7.83□□□□□ -1.16
RTT105YER104W TFA1P36100 482 aa7.83□□□□□ -1.16
RTT105YER104W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RTT105YER104W MID1P41821 548 aa7.77□□□□□ -1.17
RTT105YER104W PEX29Q03370 554 aa7.75□□□□□ -1.17
RTT105YER104W ATH1P48016 1211 aa7.71□□□□□ -1.18
RTT105YER104W HAP5Q02516 242 aa7.71□□□□□ -1.18
RTT105YER104W GUT1P32190 709 aa7.7□□□□□ -1.18
RTT105YER104W BNI4P53858 892 aa7.69□□□□□ -1.18
RTT105YER104W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RTT105YER104W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RTT105YER104W NST1P53935 1240 aa7.65□□□□□ -1.18
RTT105YER104W MIF2P35201 549 aa7.62□□□□□ -1.19
RTT105YER104W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
RTT105YER104W RAS1P01119 309 aa7.6□□□□□ -1.19
RTT105YER104W AI4P03878 556 aa7.6□□□□□ -1.19
RTT105YER104W MPH3P0CE00 602 aa7.6□□□□□ -1.19
RTT105YER104W SOL3P38858 249 aa7.56□□□□□ -1.2
RTT105YER104W TRK1P12685 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
RTT105YER104W EDS1P38073 919 aa7.55□□□□□ -1.2
RTT105YER104W MPC54Q08550 464 aa7.53□□□□□ -1.2
RTT105YER104W MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RTT105YER104W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RTT105YER104W NMA111P53920 997 aa7.48□□□□□ -1.21
RTT105YER104W YPL062WQ02781 134 aa7.48□□□□□ -1.21
RTT105YER104W AMS1P22855 1083 aa7.46□□□□□ -1.22
RTT105YER104W YPR015CQ12531 247 aa7.41□□□□□ -1.22
RTT105YER104W COQ8P27697 501 aa7.4□□□□□ -1.22
RTT105YER104W DPL1Q05567 589 aa7.4□□□□□ -1.22
RTT105YER104W GYP1Q08484 637 aa7.39□□□□□ -1.23
RTT105YER104W YGR273CP53329 174 aa7.37□□□□□ -1.23
RTT105YER104W RAM2P29703 316 aa7.36□□□□□ -1.23
RTT105YER104W RAM1P22007 431 aa7.35□□□□□ -1.23
RTT105YER104W SLI15P38283 698 aa7.35□□□□□ -1.23
RTT105YER104W SAS4Q04003 481 aa7.31□□□□□ -1.24
RTT105YER104W ISU2Q12056 156 aa7.31□□□□□ -1.24
RTT105YER104W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.29□□□□□ -1.24
RTT105YER104W SDH2P21801 266 aa7.28□□□□□ -1.24
RTT105YER104W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RTT105YER104W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data7.23□□□□□ -1.25not detected
RTT105YER104W GAR1P28007 205 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RTT105YER104W BRE2P43132 505 aa7.21□□□□□ -1.26
RTT105YER104W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RTT105YER104W GCR2Q01722 534 aa7.19□□□□□ -1.26
RTT105YER104W PDR1P12383 1068 aa7.17□□□□□ -1.26
RTT105YER104W CDC73Q06697 393 aa7.15□□□□□ -1.26
RTT105YER104W KEX1P09620 729 aa7.13□□□□□ -1.27
RTT105YER104W AIR1P40507 360 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RTT105YER104W ERG12P07277 443 aa7.05□□□□□ -1.28
RTT105YER104W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RTT105YER104W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RTT105YER104W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RTT105YER104W CLA4P48562 842 aa6.99□□□□□ -1.29
RTT105YER104W MET22P32179 357 aa6.98□□□□□ -1.29
RTT105YER104W CST6P40535 587 aa6.98□□□□□ -1.29
RTT105YER104W ENV9Q08651 330 aa6.97□□□□□ -1.29
RTT105YER104W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RTT105YER104W CDC4P07834 779 aa6.93□□□□□ -1.3
RTT105YER104W UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RTT105YER104W LAM6Q08001 693 aa6.93□□□□□ -1.3
RTT105YER104W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3not detected
RTT105YER104W STR2P47164 639 aa6.92□□□□□ -1.3
RTT105YER104W RAD54P32863 898 aa6.91□□□□□ -1.3
RTT105YER104W YRR1Q12172 810 aa6.91□□□□□ -1.3
RTT105YER104W VHR2P40041 505 aa6.9□□□□□ -1.3
RTT105YER104W YDR444WQ04093 687 aa6.9□□□□□ -1.3
RTT105YER104W ISM1P48526 1002 aa6.89□□□□□ -1.31
RTT105YER104W PEX21P50091 288 aa6.88□□□□□ -1.31
RTT105YER104W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RTT105YER104W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RTT105YER104W NUD1P32336 851 aa6.84□□□□□ -1.31
RTT105YER104W NPL4P33755 580 aa6.83□□□□□ -1.32
RTT105YER104W YDL176WQ12027 708 aa6.82□□□□□ -1.32
RTT105YER104W HED1Q03937 162 aa6.81□□□□□ -1.32
RTT105YER104W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RTT105YER104W BDP1P46678 594 aa6.8□□□□□ -1.32
RTT105YER104W TFB4Q12004 338 aa6.8□□□□□ -1.32
RTT105YER104W GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RTT105YER104W MTC5Q03897 1148 aa6.79□□□□□ -1.32
RTT105YER104W CSC1Q06538 782 aa6.78□□□□□ -1.32
RTT105YER104W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RTT105YER104W TY1A-DR4O74302 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-AP0CX57 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.76□□□□□ -1.33
RTT105YER104W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.76□□□□□ -1.33
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