RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SSP1P38871 571 aa7.84□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C YEL023CP39992 682 aa7.81□□□□□ -1.16
GCN4YEL009C VRP1P37370 817 aa7.79□□□□□ -1.16
GCN4YEL009C MGA2P40578 1113 aa7.79□□□□□ -1.16
GCN4YEL009C DCW1P36091 449 aa7.76□□□□□ -1.17
GCN4YEL009C CST9Q06032 482 aa7.73□□□□□ -1.17
GCN4YEL009C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
GCN4YEL009C DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
GCN4YEL009C PML39Q03760 334 aa7.65□□□□□ -1.18
GCN4YEL009C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
GCN4YEL009C ARH1P48360 493 aa7.61□□□□□ -1.19
GCN4YEL009C RCR1P38212 213 aa7.6□□□□□ -1.19
GCN4YEL009C RGA2Q06407 1009 aa7.58□□□□□ -1.2
GCN4YEL009C SPT23P35210 1082 aa7.56□□□□□ -1.2
GCN4YEL009C ATH1P48016 1211 aa7.54□□□□□ -1.2
GCN4YEL009C GUT1P32190 709 aa7.53□□□□□ -1.2
GCN4YEL009C PEX29Q03370 554 aa7.52□□□□□ -1.21
GCN4YEL009C YDR344CQ05510 147 aa7.49□□□□□ -1.21
GCN4YEL009C RGA1P39083 1007 aa7.47□□□□□ -1.21
GCN4YEL009C HAP5Q02516 242 aa7.46□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C MIF2P35201 549 aa7.45□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C BNI4P53858 892 aa7.44□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C MID1P41821 548 aa7.43□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C AI4P03878 556 aa7.41□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C SRC1Q03707 834 aa7.4□□□□□ -1.22
GCN4YEL009C MPH3P0CE00 602 aa7.38□□□□□ -1.23
GCN4YEL009C NST1P53935 1240 aa7.34□□□□□ -1.23
GCN4YEL009C EDS1P38073 919 aa7.3□□□□□ -1.24
GCN4YEL009C MPC54Q08550 464 aa7.27□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C COQ8P27697 501 aa7.26□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C SOL3P38858 249 aa7.26□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C NMA111P53920 997 aa7.26□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C TRK1P12685 1235 aa7.22□□□□□ -1.25
GCN4YEL009C RAM2P29703 316 aa7.21□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C DPL1Q05567 589 aa7.21□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C RAS1P01119 309 aa7.19□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C YGR273CP53329 174 aa7.19□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C GYP1Q08484 637 aa7.18□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C AMS1P22855 1083 aa7.17□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C SAS4Q04003 481 aa7.16□□□□□ -1.26
GCN4YEL009C ISU2Q12056 156 aa7.14□□□□□ -1.27
GCN4YEL009C SLI15P38283 698 aa7.13□□□□□ -1.27
GCN4YEL009C YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.1□□□□□ -1.27
GCN4YEL009C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GCN4YEL009C YPL062WQ02781 134 aa7.07□□□□□ -1.28
GCN4YEL009C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GCN4YEL009C RAM1P22007 431 aa7.05□□□□□ -1.28
GCN4YEL009C YPR015CQ12531 247 aa7.05□□□□□ -1.28
GCN4YEL009C GCR2Q01722 534 aa7.01□□□□□ -1.29
GCN4YEL009C KEX1P09620 729 aa6.98□□□□□ -1.29
GCN4YEL009C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.98□□□□□ -1.29not detected
GCN4YEL009C CDC73Q06697 393 aa6.93□□□□□ -1.3
GCN4YEL009C BRE2P43132 505 aa6.92□□□□□ -1.3
GCN4YEL009C ERG12P07277 443 aa6.91□□□□□ -1.3
GCN4YEL009C PDR1P12383 1068 aa6.9□□□□□ -1.3
GCN4YEL009C SDH2P21801 266 aa6.9□□□□□ -1.3
GCN4YEL009C GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
GCN4YEL009C PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GCN4YEL009C RAD54P32863 898 aa6.84□□□□□ -1.31
GCN4YEL009C PEX21P50091 288 aa6.84□□□□□ -1.31
GCN4YEL009C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C NPL4P33755 580 aa6.78□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.78□□□□□ -1.32not detected
GCN4YEL009C IFH1P39520 1085 aa6.78□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C VHR2P40041 505 aa6.78□□□□□ -1.32
GCN4YEL009C KIC1P38692 1080 aa6.76□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C TFB4Q12004 338 aa6.75□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C YRR1Q12172 810 aa6.75□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C CDC4P07834 779 aa6.74□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C CSC1Q06538 782 aa6.73□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C ENV9Q08651 330 aa6.72□□□□□ -1.33
GCN4YEL009C PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C NUD1P32336 851 aa6.7□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C CST6P40535 587 aa6.7□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C STR2P47164 639 aa6.7□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C MET22P32179 357 aa6.69□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C LAM6Q08001 693 aa6.69□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C ISM1P48526 1002 aa6.68□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C GCD11P32481 527 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C HED1Q03937 162 aa6.66□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C YDR444WQ04093 687 aa6.66□□□□□ -1.34
GCN4YEL009C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GCN4YEL009C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GCN4YEL009C CLA4P48562 842 aa6.63□□□□□ -1.35
GCN4YEL009C BDP1P46678 594 aa6.6□□□□□ -1.35
GCN4YEL009C YDR090CQ03193 310 aa6.59□□□□□ -1.35
GCN4YEL009C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C RRN7P40992 514 aa6.56□□□□□ -1.36
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