RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	YDL129W	Q07555	291 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	RLF2	Q12495	606 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	MRM1	P25270	412 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	XDJ1	P39102	459 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	JIP4	Q03361	876 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	DAN4	P47179	1161 aa		4.29	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	SAM3	Q08986	587 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	CKB1	P43639	278 aa		4.28	□□□□□ -1.72
AI2	Q0055	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
AI2	Q0055	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	VRP1	P37370	817 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	RTG3	P38165	486 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	RCR1	P38212	213 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	RAM2	P29703	316 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	YFR006W	P43590	535 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	RGA1	P39083	1007 aa		4.22	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	VPS29	P38759	282 aa		4.21	□□□□□ -1.73
AI2	Q0055	DSF2	P38213	736 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	PTC4	P38089	393 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	HTA2	P04912	132 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	STS1	P38637	319 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	GYP5	Q12344	894 aa		4.19	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	MAM3	Q12296	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	YML020W	Q03722	664 aa		4.17	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	YEL023C	P39992	682 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	DCW1	P36091	449 aa		4.15	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	ATG36	P46983	293 aa		4.15	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
AI2	Q0055	MRX12	P47084	519 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	YDR344C	Q05510	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	KIN1	P13185	1064 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	SRC1	Q03707	834 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	COQ8	P27697	501 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	PML39	Q03760	334 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	AIM7	Q12156	149 aa		4.09	□□□□□ -1.75
AI2	Q0055	DIT2	P21595	489 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	EDS1	P38073	919 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	ARH1	P48360	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	VPS70	P47161	811 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	MIF2	P35201	549 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	SPT23	P35210	1082 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	SLX8	P40072	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	PBS2	P08018	668 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	GLC3	P32775	704 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	HPC2	Q01448	625 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AI2	Q0055	PKC1	P24583	1151 aa		4.03	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	GEF1	P37020	779 aa		4.03	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	OCA5	P38738	679 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	LAM6	Q08001	693 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	MID1	P41821	548 aa		4	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	FAR11	P53917	953 aa		4	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	TFB3	Q03290	321 aa		4	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	GUT1	P32190	709 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	YDR090C	Q03193	310 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	PEX29	Q03370	554 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	DOS2	P54858	310 aa		3.98	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	SWE1	P32944	819 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	HAP5	Q02516	242 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	ATH1	P48016	1211 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	BNI4	P53858	892 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AI2	Q0055	NST1	P53935	1240 aa		3.96	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	SPC42	P36094	363 aa		3.96	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	ATG32	P40458	529 aa		3.96	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	COX6	P00427	148 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	SOL3	P38858	249 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	IES2	P40154	320 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	YGR273C	P53329	174 aa		3.94	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	RAS1	P01119	309 aa		3.94	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	BIM1	P40013	344 aa		3.94	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	ERG12	P07277	443 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	AIM44	Q99299	758 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AI2	Q0055	TOP1	P04786	769 aa		3.93	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9 ms