RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637264.1

POLG-222, Transcript of DNA polymerase gamma, catalytic subunit, human

TSL 5

Gene POLG, Length 3,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLG-222	ENST00000637264	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		14.41	□□□□□ -0.1
POLG-222	ENST00000637264	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		14.41	□□□□□ -0.1
POLG-222	ENST00000637264	NACAD	O15069	1562 aa		14.41	□□□□□ -0.1
POLG-222	ENST00000637264	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	14.4	□□□□□ -0.1
POLG-222	ENST00000637264	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		14.38	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		14.37	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		14.37	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	14.36	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	WDR97	A6NE52	1622 aa		14.36	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		14.35	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		14.34	□□□□□ -0.11
POLG-222	ENST00000637264	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		14.31	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14.31	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	NEFM	P07197	916 aa		14.3	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	KIF21B	O75037	1637 aa		14.3	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		14.28	□□□□□ -0.12
POLG-222	ENST00000637264	MAPKBP1	O60336	1514 aa		14.23	□□□□□ -0.13
POLG-222	ENST00000637264	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	14.23	□□□□□ -0.13	6e-6	■■□□□ 12.8
POLG-222	ENST00000637264	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		14.23	□□□□□ -0.13
POLG-222	ENST00000637264	MRS2	Q9HD23	443 aa		14.22	□□□□□ -0.13
POLG-222	ENST00000637264	TONSL	Q96HA7	1378 aa		14.2	□□□□□ -0.14
POLG-222	ENST00000637264	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
POLG-222	ENST00000637264	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		14.19	□□□□□ -0.14
POLG-222	ENST00000637264	SMARCA2	P51531	1590 aa		14.18	□□□□□ -0.14
POLG-222	ENST00000637264	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	14.15	□□□□□ -0.14
POLG-222	ENST00000637264	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		14.14	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		14.13	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	ARAP1	Q96P48	1450 aa		14.12	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		14.12	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	AKNA	Q7Z591	1439 aa		14.11	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	P3H3	Q8IVL6	736 aa		14.1	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	SLC4A3	P48751	1232 aa		14.1	□□□□□ -0.15
POLG-222	ENST00000637264	SYNJ1	O43426	1573 aa		14.08	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	CUX2	O14529	1486 aa		14.08	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	GSE1	Q14687	1217 aa		14.05	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		14.05	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	SKAP1	Q86WV1	359 aa		14.04	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	PDE4A	P27815	886 aa		14.03	□□□□□ -0.16
POLG-222	ENST00000637264	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		14.02	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	USP35	Q9P2H5	1018 aa		14.01	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		14.01	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.99	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.99	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.98	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	ARX	Q96QS3	562 aa		13.98	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.98	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.97	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.96	□□□□□ -0.17
POLG-222	ENST00000637264	SMARCA4	P51532	1647 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	FOXD1	Q16676	465 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POLG-222	ENST00000637264	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.89	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		13.88	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.87	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	PLIN1	O60240	522 aa		13.86	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	PRX	Q9BXM0	1461 aa		13.86	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.84	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.19
POLG-222	ENST00000637264	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.83	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.82	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.81	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.8	□□□□□ -0.2
POLG-222	ENST00000637264	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.2	8e-7	■■■■□ 26.1
POLG-222	ENST00000637264	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLG-222	ENST00000637264	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.77	□□□□□ -0.21
POLG-222	ENST00000637264	MS4A1	P11836	297 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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