RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SOGA1O94964 1423 aa28.14■■■□□ 2.1
PTPRJ-208ENST00000615445 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRJ-208ENST00000615445 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PTPRJ-208ENST00000615445 TMC1Q8TDI8 760 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.089e-7■■■■□ 24.4
PTPRJ-208ENST00000615445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PTPRJ-208ENST00000615445 MRS2Q9HD23 443 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRJ-208ENST00000615445 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRJ-208ENST00000615445 CUX2O14529 1486 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRJ-208ENST00000615445 RGL3Q3MIN7 710 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRJ-208ENST00000615445 ERCC6Q03468 1493 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC8Q09428 1581 aa27.9■■■□□ 2.06
PTPRJ-208ENST00000615445 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PTPRJ-208ENST00000615445 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
PTPRJ-208ENST00000615445 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRJ-208ENST00000615445 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRJ-208ENST00000615445 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCA2P51531 1590 aa27.79■■■□□ 2.04
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.76■■■□□ 2.03
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.73■■■□□ 2.03
PTPRJ-208ENST00000615445 WIZO95785 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.67■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PTPRJ-208ENST00000615445 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.59■■■□□ 2.01
PTPRJ-208ENST00000615445 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.57■■■□□ 2
PTPRJ-208ENST00000615445 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
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PTPRJ-208ENST00000615445 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.51■■□□□ 1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.45■■□□□ 1.99
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PTPRJ-208ENST00000615445 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRJ-208ENST00000615445 FMN1Q68DA7 1419 aa27.39■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHG5O94827 1062 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCA4P51532 1647 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 C14orf37Q86TY3 774 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP53Q96M91 514 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD1Q16676 465 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRJ-208ENST00000615445 PKD2Q13563 968 aa27.31■■□□□ 1.96
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PTPRJ-208ENST00000615445 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROD2Q15784 382 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KANK1Q14678 1352 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TMF1P82094 1093 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRJ-208ENST00000615445 GGT6Q6P531 493 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NBR1Q14596 966 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NUP155O75694 1391 aa27.14■■□□□ 1.93
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PTPRJ-208ENST00000615445 NUDCQ9Y266 331 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 JPH4Q96JJ6 628 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0G2JS52 829 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-208ENST00000615445 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
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PTPRJ-208ENST00000615445 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRJ-208ENST00000615445 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
PTPRJ-208ENST00000615445 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRJ-208ENST00000615445 L3MBTL2Q969R5 705 aa27■■□□□ 1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRJ-208ENST00000615445 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF3BO15066 747 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 STK26Q9P289 416 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-208ENST00000615445 ARXQ96QS3 562 aa26.92■■□□□ 1.9
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