RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 MIER1Q8N108 512 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 SCRIBQ14160 1630 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRT-209ENST00000612229 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
PTPRT-209ENST00000612229 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 EEA1Q15075 1411 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A1P11836 297 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 CLIP1P30622 1438 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 CDCA8Q53HL2 280 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 P3H3Q8IVL6 736 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA3Q08378 1498 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 HSCBQ8IWL3 235 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP53Q96M91 514 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 MCCP23508 829 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 FBLN2P98095 1184 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-209ENST00000612229 TPM4P67936 248 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 FOXD1Q16676 465 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 ABCC9O60706 1549 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 GBP4Q96PP9 640 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 CEP162Q5TB80 1403 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 PHF14O94880 888 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 GPS2Q13227 327 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 DRC7Q8IY82 874 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 TSPY4P0CV99 314 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 TSPY10P0CW01 314 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 CCER2I3L3R5 266 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 ARID3CA6NKF2 412 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 PLCB2Q00722 1185 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA2Q08379 1002 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRT-209ENST00000612229 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.83□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 FGD1P98174 961 aa8.83□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.82□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 RGS3P49796 1198 aa8.82□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 HMMRO75330 724 aa8.82□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.81□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.81□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CLSTN1O94985 981 aa8.81□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CEP89Q96ST8 783 aa8.8□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.8□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 NUDCQ9Y266 331 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 KIF3AQ9Y496 699 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ4P48050 445 aa8.78□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.77□□□□□ -1
PTPRT-209ENST00000612229 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 NPHP1O15259 732 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 TPM3P06753 285 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 CDR1P51861 262 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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