RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562102.5

ATF7IP2-208, Transcript of activating transcription factor 7 interacting protein 2, human

TSL 4

Gene ATF7IP2, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATF7IP2-208	ENST00000562102	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ATF7IP2-208	ENST00000562102	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.96	□□□□□ -0.5
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ATF7IP2-208	ENST00000562102	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5	4e-9	■□□□□ 8.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MAPKBP1	O60336	1514 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ZBTB22	O15209	634 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCC8	Q09428	1581 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
ATF7IP2-208	ENST00000562102	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	WIZ	O95785	1651 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ATF7IP2-208	ENST00000562102	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SOGA1	O94964	1423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ATF7IP2-208	ENST00000562102	NUP160	Q12769	1436 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ATF7IP2-208	ENST00000562102	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATF7IP2-208	ENST00000562102	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ATF7IP2-208	ENST00000562102	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PTPRM	P28827	1452 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.57	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	GLI2	P10070	1586 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	KIF21B	O75037	1637 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ATF7IP2-208	ENST00000562102	APLP2	Q06481	763 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		11.44	□□□□□ -0.58
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
ATF7IP2-208	ENST00000562102	HSPA2	P54652	639 aa		11.42	□□□□□ -0.58
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.4	□□□□□ -0.58
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MADD	Q8WXG6	1647 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CUX1	P39880	1505 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CAPN15	O75808	1086 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CUL7	Q14999	1698 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ATF7IP2-208	ENST00000562102	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATF7IP2-208	ENST00000562102	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATF7IP2-208	ENST00000562102	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PTPRT	O14522	1441 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	PTPRG	P23470	1445 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATF7IP2-208	ENST00000562102	DSG3	P32926	999 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	ABCB7	O75027	752 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	POLA2	Q14181	598 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ATF7IP2-208	ENST00000562102	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms