RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD3-208ENST00000560725 FAM212AQ96EL1 285 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 CREBZFQ9NS37 354 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.25□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.22□□□□□ -0.29
TMOD3-208ENST00000560725 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
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TMOD3-208ENST00000560725 MS4A3Q96HJ5 214 aa12.32□□□□□ -0.44
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TMOD3-208ENST00000560725 PDE4AP27815 886 aa12.3□□□□□ -0.44
TMOD3-208ENST00000560725 TIE1P35590 1138 aa12.29□□□□□ -0.44
TMOD3-208ENST00000560725 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
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TMOD3-208ENST00000560725 MFSD10Q14728 455 aa12.28□□□□□ -0.44
TMOD3-208ENST00000560725 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.27□□□□□ -0.45
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TMOD3-208ENST00000560725 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
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TMOD3-208ENST00000560725 CLCN6P51797 869 aa12.18□□□□□ -0.46
TMOD3-208ENST00000560725 SEMA3EO15041 775 aa12.17□□□□□ -0.46
TMOD3-208ENST00000560725 CAMK2BQ13554 666 aa12.17□□□□□ -0.46
TMOD3-208ENST00000560725 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.17□□□□□ -0.46
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TMOD3-208ENST00000560725 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.13□□□□□ -0.47
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TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.1□□□□□ -0.47
TMOD3-208ENST00000560725 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TMOD3-208ENST00000560725 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM132AQ24JP5 1023 aa12.09□□□□□ -0.47
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TMOD3-208ENST00000560725 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.04□□□□□ -0.48
TMOD3-208ENST00000560725 HAX1O00165 279 aa12.02□□□□□ -0.49
TMOD3-208ENST00000560725 IER5LQ5T953 404 aa12.02□□□□□ -0.49
TMOD3-208ENST00000560725 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
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