RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556816.5

ISCA2-204, Transcript of iron-sulfur cluster assembly 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ISCA2, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA2-204ENST00000556816 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.6■■□□□ 1.21
ISCA2-204ENST00000556816 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.58■■□□□ 1.21
ISCA2-204ENST00000556816 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ISCA2-204ENST00000556816 MAP3K1Q13233 1512 aa22.57■■□□□ 1.2
ISCA2-204ENST00000556816 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-204ENST00000556816 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.56■■□□□ 1.2
ISCA2-204ENST00000556816 NESP48681 1621 aa22.53■■□□□ 1.2
ISCA2-204ENST00000556816 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.52■■□□□ 1.2
ISCA2-204ENST00000556816 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 TOPBP1Q92547 1522 aa22.5■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.49■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 MAPKBP1O60336 1514 aa22.46■■□□□ 1.19
ISCA2-204ENST00000556816 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.42■■□□□ 1.18
ISCA2-204ENST00000556816 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.41■■□□□ 1.18
ISCA2-204ENST00000556816 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.38■■□□□ 1.17
ISCA2-204ENST00000556816 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
ISCA2-204ENST00000556816 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.36■■□□□ 1.17
ISCA2-204ENST00000556816 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-204ENST00000556816 CUL7Q14999 1698 aa22.34■■□□□ 1.17
ISCA2-204ENST00000556816 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ISCA2-204ENST00000556816 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
ISCA2-204ENST00000556816 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.3■■□□□ 1.16
ISCA2-204ENST00000556816 FMN1Q68DA7 1419 aa22.29■■□□□ 1.16
ISCA2-204ENST00000556816 WDR97A6NE52 1622 aa22.27■■□□□ 1.16
ISCA2-204ENST00000556816 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.26■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.24■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 KCNH8Q96L42 1107 aa22.24■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.23■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.23■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.23■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
ISCA2-204ENST00000556816 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ISCA2-204ENST00000556816 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.17■■□□□ 1.14
ISCA2-204ENST00000556816 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.17■■□□□ 1.14
ISCA2-204ENST00000556816 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.16■■□□□ 1.14
ISCA2-204ENST00000556816 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ISCA2-204ENST00000556816 PTPRKQ15262 1439 aa22.13■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 SAMD9Q5K651 1589 aa22.13■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.12■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 NCOA2Q15596 1464 aa22.11■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 GRIN2BQ13224 1484 aa22.1■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 TONSLQ96HA7 1378 aa22.09■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.08■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.08■■□□□ 1.13
ISCA2-204ENST00000556816 HFM1A2PYH4 1435 aa22.07■■□□□ 1.12
ISCA2-204ENST00000556816 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.05■■□□□ 1.12
ISCA2-204ENST00000556816 UACAQ9BZF9 1416 aa22.04■■□□□ 1.12
ISCA2-204ENST00000556816 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.03■■□□□ 1.12
ISCA2-204ENST00000556816 NAIPQ13075 1403 aa22.02■■□□□ 1.12
ISCA2-204ENST00000556816 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.01■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.01■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 ARID3CA6NKF2 412 aa22.01■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.98■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.96■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 ANP32CO43423 234 aa21.95■■□□□ 1.11
ISCA2-204ENST00000556816 TRIM52Q96A61 297 aa21.92■■□□□ 1.1
ISCA2-204ENST00000556816 ARHGEF11O15085 1522 aa21.9■■□□□ 1.1
ISCA2-204ENST00000556816 IQGAP2Q13576 1575 aa21.89■■□□□ 1.1
ISCA2-204ENST00000556816 PBRM1Q86U86 1689 aa21.88■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 HECW1Q76N89 1606 aa21.88■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 CCER2I3L3R5 266 aa21.87■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 BCANQ96GW7 911 aa21.86■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 ADAMTS12P58397 1594 aa21.84■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ISCA2-204ENST00000556816 FKBP8Q14318 412 aa21.82■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.81■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.79■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 FOXD1Q16676 465 aa21.78■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 KDM6BO15054 1643 aa21.78■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 WDR62O43379 1518 aa21.78■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.77■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 MIA2Q96PC5 1412 aa21.77■■□□□ 1.08
ISCA2-204ENST00000556816 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.76■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.75■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 AKNAQ7Z591 1439 aa21.73■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 NEFLP07196 543 aa21.71■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ISCA2-204ENST00000556816 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.7■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.7■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 IFT140Q96RY7 1462 aa21.69■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.67■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 DISP1Q96F81 1524 aa21.66■■□□□ 1.06
ISCA2-204ENST00000556816 DAPK1P53355 1430 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms