RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555589.5

RIN3-206, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RIN3, Length 2,814 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-206ENST00000555589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.05■■□□□ 1.28
RIN3-206ENST00000555589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.05■■□□□ 1.28
RIN3-206ENST00000555589 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.04■■□□□ 1.28
RIN3-206ENST00000555589 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.02■■□□□ 1.28
RIN3-206ENST00000555589 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.02■■□□□ 1.28
RIN3-206ENST00000555589 PRDM2Q13029 1718 aa23.01■■□□□ 1.27
RIN3-206ENST00000555589 NESP48681 1621 aa22.99■■□□□ 1.27
RIN3-206ENST00000555589 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.99■■□□□ 1.27
RIN3-206ENST00000555589 TIAM1Q13009 1591 aa22.96■■□□□ 1.27
RIN3-206ENST00000555589 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.95■■□□□ 1.26
RIN3-206ENST00000555589 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.94■■□□□ 1.26
RIN3-206ENST00000555589 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.93■■□□□ 1.26
RIN3-206ENST00000555589 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.86■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.86■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.85■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 TOPBP1Q92547 1522 aa22.84■■□□□ 1.25
RIN3-206ENST00000555589 MAPKBP1O60336 1514 aa22.83■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 KCNH8Q96L42 1107 aa22.82■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.78■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 MAP3K1Q13233 1512 aa22.78■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.78■■□□□ 1.24
RIN3-206ENST00000555589 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RIN3-206ENST00000555589 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 WDR97A6NE52 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.67■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.66■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.66■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.65■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 ARID3CA6NKF2 412 aa22.64■■□□□ 1.22
RIN3-206ENST00000555589 FMN1Q68DA7 1419 aa22.59■■□□□ 1.21
RIN3-206ENST00000555589 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RIN3-206ENST00000555589 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.59■■□□□ 1.21
RIN3-206ENST00000555589 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.58■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 CUL7Q14999 1698 aa22.57■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.57■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.57■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 PTPRKQ15262 1439 aa22.56■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.56■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.54■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
RIN3-206ENST00000555589 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.51■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.49■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 TONSLQ96HA7 1378 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.48■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 NCOA2Q15596 1464 aa22.47■■□□□ 1.19
RIN3-206ENST00000555589 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 BCANQ96GW7 911 aa22.44■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.43■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 TRIM52Q96A61 297 aa22.42■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.41■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 GRIN2BQ13224 1484 aa22.4■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.4■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 SAMD9Q5K651 1589 aa22.39■■□□□ 1.18
RIN3-206ENST00000555589 HFM1A2PYH4 1435 aa22.39■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 NAIPQ13075 1403 aa22.39■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 ANP32CO43423 234 aa22.37■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 UACAQ9BZF9 1416 aa22.36■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.36■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 FOXD1Q16676 465 aa22.35■■□□□ 1.17
RIN3-206ENST00000555589 MSH5O43196 834 aa22.32■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 FKBP8Q14318 412 aa22.3■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.27■■□□□ 1.16
RIN3-206ENST00000555589 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
RIN3-206ENST00000555589 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RIN3-206ENST00000555589 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RIN3-206ENST00000555589 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RIN3-206ENST00000555589 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.2■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 IQGAP2Q13576 1575 aa22.19■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 KDM6BO15054 1643 aa22.19■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 CCER2I3L3R5 266 aa22.19■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.17■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 PBRM1Q86U86 1689 aa22.17■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 ARHGEF11O15085 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.16■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.15■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 HECW1Q76N89 1606 aa22.14■■□□□ 1.14
RIN3-206ENST00000555589 FBLN2P98095 1184 aa22.14■■□□□ 1.13
RIN3-206ENST00000555589 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.13■■□□□ 1.13
RIN3-206ENST00000555589 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.13■■□□□ 1.13
RIN3-206ENST00000555589 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
RIN3-206ENST00000555589 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.11■■□□□ 1.13
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