RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TOPBP1Q92547 1522 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-217ENST00000550044 FBLN2P98095 1184 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-217ENST00000550044 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.43e-15■■■■■ 29.1
CS-217ENST00000550044 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
CS-217ENST00000550044 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-217ENST00000550044 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CS-217ENST00000550044 ABCC8Q09428 1581 aa17.48■□□□□ 0.39
CS-217ENST00000550044 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.45■□□□□ 0.38
CS-217ENST00000550044 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CS-217ENST00000550044 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.39■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 AKT1S1Q96B36 256 aa17.36■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.35■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 SYNJ1O43426 1573 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.34■□□□□ 0.37
CS-217ENST00000550044 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CS-217ENST00000550044 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
CS-217ENST00000550044 SOGA1O94964 1423 aa17.28■□□□□ 0.36
CS-217ENST00000550044 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
CS-217ENST00000550044 WDR97A6NE52 1622 aa17.25■□□□□ 0.35
CS-217ENST00000550044 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CS-217ENST00000550044 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.24■□□□□ 0.35
CS-217ENST00000550044 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-217ENST00000550044 SYNJ2O15056 1496 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-217ENST00000550044 GRIN2BQ13224 1484 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-217ENST00000550044 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CS-217ENST00000550044 PBRM1Q86U86 1689 aa17.16■□□□□ 0.34
CS-217ENST00000550044 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.14■□□□□ 0.33
CS-217ENST00000550044 CUX1P39880 1505 aa17.11■□□□□ 0.33
CS-217ENST00000550044 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.11■□□□□ 0.33
CS-217ENST00000550044 HAX1O00165 279 aa17.1■□□□□ 0.33
CS-217ENST00000550044 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.05■□□□□ 0.32
CS-217ENST00000550044 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.02■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 CEP170Q5SW79 1584 aa17.02■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 GRIN2AQ12879 1464 aa16.99■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 PITPNM1O00562 1244 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.96■□□□□ 0.31
CS-217ENST00000550044 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.96■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 ADAMTS12P58397 1594 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 SHROOM2Q13796 1616 aa16.94■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 NUP160Q12769 1436 aa16.93■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CS-217ENST00000550044 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.84■□□□□ 0.29
CS-217ENST00000550044 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.84■□□□□ 0.29
CS-217ENST00000550044 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CS-217ENST00000550044 KDM6BO15054 1643 aa16.83■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.83■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 DIP2BQ9P265 1576 aa16.82■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.81■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 MAPKBP1O60336 1514 aa16.79■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.78■□□□□ 0.28
CS-217ENST00000550044 TSPOAP1O95153 1857 aa16.77■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.74■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 JPH4Q96JJ6 628 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-217ENST00000550044 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 TOP2BQ02880 1626 aa16.68■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 SPDYE6P0CI01 402 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 EVX2Q03828 476 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.65■□□□□ 0.26
CS-217ENST00000550044 ADGRL1O94910 1474 aa16.63■□□□□ 0.25
CS-217ENST00000550044 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.61■□□□□ 0.25
CS-217ENST00000550044 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.6■□□□□ 0.25
CS-217ENST00000550044 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CS-217ENST00000550044 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-217ENST00000550044 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-217ENST00000550044 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-217ENST00000550044 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-217ENST00000550044 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.51■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 GLI2P10070 1586 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 ASXL2Q76L83 1435 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 PTPRGP23470 1445 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 ABCC2Q92887 1545 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 CUL7Q14999 1698 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-217ENST00000550044 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-217ENST00000550044 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-217ENST00000550044 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-217ENST00000550044 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-217ENST00000550044 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.38■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.37■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 IGF1RP08069 1367 aa16.36■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 GABBR2O75899 941 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 FBXO41Q8TF61 875 aa16.35■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 ZBTB22O15209 634 aa16.34■□□□□ 0.21
CS-217ENST00000550044 LHX8Q68G74 356 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-217ENST00000550044 UACAQ9BZF9 1416 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-217ENST00000550044 IQGAP2Q13576 1575 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-217ENST00000550044 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
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