RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
C4BPB-208	ENST00000492730	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		10.02	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCA4	P51532	1647 aa		10	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		9.99	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	POTEJ	P0CG39	1038 aa		9.98	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	NCAPD3	P42695	1498 aa		9.98	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		9.97	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		9.97	□□□□□ -0.81
C4BPB-208	ENST00000492730	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCA2	P51531	1590 aa		9.93	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		9.93	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		9.91	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	9.91	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	WIZ	O95785	1651 aa		9.9	□□□□□ -0.82
C4BPB-208	ENST00000492730	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	9.89	□□□□□ -0.83
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	9.86	□□□□□ -0.83
C4BPB-208	ENST00000492730	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		9.86	□□□□□ -0.83
C4BPB-208	ENST00000492730	C7	P10643	843 aa		9.85	□□□□□ -0.83
C4BPB-208	ENST00000492730	METRN	Q9UJH8	293 aa		9.85	□□□□□ -0.83
C4BPB-208	ENST00000492730	HMGXB3	Q12766	1538 aa		9.83	□□□□□ -0.84
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC39A7	Q92504	469 aa		9.83	□□□□□ -0.84
C4BPB-208	ENST00000492730	MMRN1	Q13201	1228 aa		9.8	□□□□□ -0.84
C4BPB-208	ENST00000492730	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
C4BPB-208	ENST00000492730	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		9.8	□□□□□ -0.84
C4BPB-208	ENST00000492730	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		9.77	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	9.75	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	NES	P48681	1621 aa		9.74	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	9.74	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		9.73	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		9.73	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF12	Q96QT6	1004 aa		9.73	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		9.73	□□□□□ -0.85
C4BPB-208	ENST00000492730	ERCC6	Q03468	1493 aa		9.67	□□□□□ -0.86
C4BPB-208	ENST00000492730	CREBZF	Q9NS37	354 aa		9.67	□□□□□ -0.86
C4BPB-208	ENST00000492730	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	9.66	□□□□□ -0.86
C4BPB-208	ENST00000492730	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		9.65	□□□□□ -0.86
C4BPB-208	ENST00000492730	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		9.65	□□□□□ -0.86
C4BPB-208	ENST00000492730	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		9.64	□□□□□ -0.87
C4BPB-208	ENST00000492730	CFTR	P13569	1480 aa		9.64	□□□□□ -0.87
C4BPB-208	ENST00000492730	POTEF	A5A3E0	1075 aa		9.61	□□□□□ -0.87
C4BPB-208	ENST00000492730	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		9.59	□□□□□ -0.87
C4BPB-208	ENST00000492730	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		9.58	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	ST18	O60284	1047 aa		9.57	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	9.55	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		9.54	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM41	Q8WV44	630 aa		9.54	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		9.53	□□□□□ -0.88
C4BPB-208	ENST00000492730	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		9.51	□□□□□ -0.89
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCC8	Q09428	1581 aa		9.5	□□□□□ -0.89
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
C4BPB-208	ENST00000492730	CUX2	O14529	1486 aa		9.47	□□□□□ -0.89
C4BPB-208	ENST00000492730	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.89
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB22	O15209	634 aa		9.45	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	9.44	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		9.43	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		9.43	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR62	O43379	1518 aa		9.42	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	TOPBP1	Q92547	1522 aa		9.42	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDM2	Q13029	1718 aa		9.4	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
C4BPB-208	ENST00000492730	SOGA1	O94964	1423 aa		9.39	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		9.38	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		9.38	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		9.38	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	9.38	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		9.37	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	CUX1	P39880	1505 aa		9.37	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		9.37	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		9.37	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNJ1	O43426	1573 aa		9.35	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		9.34	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	IFT140	Q96RY7	1462 aa		9.34	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	9.34	□□□□□ -0.91
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	SEC24B	O95487	1268 aa		9.33	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	HRC	P23327	699 aa		9.31	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	TIE1	P35590	1138 aa		9.31	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF12	Q96FN5	646 aa		9.29	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPC6	Q9Y210	931 aa		9.28	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	TOP2B	Q02880	1626 aa		9.27	□□□□□ -0.92
C4BPB-208	ENST00000492730	IER5L	Q5T953	404 aa		9.27	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		9.27	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		9.26	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		9.26	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	MARVELD3	Q96A59	401 aa		9.25	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		9.25	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		9.24	□□□□□ -0.93
C4BPB-208	ENST00000492730	SNPH	O15079	494 aa		9.24	□□□□□ -0.93

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