RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475978.1

SH3BP5L-202, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 4,122 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-202ENST00000475978 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5L-202ENST00000475978 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP5L-202ENST00000475978 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP5L-202ENST00000475978 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-202ENST00000475978 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-202ENST00000475978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP5L-202ENST00000475978 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCER2I3L3R5 266 aa19.64■□□□□ 0.73
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP5L-202ENST00000475978 KIF27Q86VH2 1401 aa19.57■□□□□ 0.72
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SH3BP5L-202ENST00000475978 MRS2Q9HD23 443 aa19.53■□□□□ 0.72
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SYNJ1O43426 1573 aa19.5■□□□□ 0.71
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SH3BP5L-202ENST00000475978 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP5L-202ENST00000475978 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.43■□□□□ 0.7
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.37■□□□□ 0.69
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SH3BP5L-202ENST00000475978 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
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SH3BP5L-202ENST00000475978 IL27Q8NEV9 243 aa19.09■□□□□ 0.65
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SH3BP5L-202ENST00000475978 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP5L-202ENST00000475978 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.06■□□□□ 0.64
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SH3BP5L-202ENST00000475978 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 CCDC7Q96M83 1385 aa18.9■□□□□ 0.62
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SH3BP5L-202ENST00000475978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP5L-202ENST00000475978 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP5L-202ENST00000475978 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.88■□□□□ 0.61
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