RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433753.4

SEMA3B-204, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA3B, Length 2,755 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-204ENST00000433753 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
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SEMA3B-204ENST00000433753 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.35■■□□□ 1.65
SEMA3B-204ENST00000433753 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SEMA3B-204ENST00000433753 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.34■■□□□ 1.65
SEMA3B-204ENST00000433753 TOPBP1Q92547 1522 aa25.33■■□□□ 1.64
SEMA3B-204ENST00000433753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.3■■□□□ 1.64
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SEMA3B-204ENST00000433753 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-204ENST00000433753 MAP3K1Q13233 1512 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA3B-204ENST00000433753 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.27■■□□□ 1.64
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SEMA3B-204ENST00000433753 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA3B-204ENST00000433753 MAPKBP1O60336 1514 aa25.21■■□□□ 1.63
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SEMA3B-204ENST00000433753 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.04■■□□□ 1.6
SEMA3B-204ENST00000433753 KCNH8Q96L42 1107 aa25.04■■□□□ 1.6
SEMA3B-204ENST00000433753 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SEMA3B-204ENST00000433753 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.01■■□□□ 1.59
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SEMA3B-204ENST00000433753 FMN1Q68DA7 1419 aa25■■□□□ 1.59
SEMA3B-204ENST00000433753 MTUS2Q5JR59 1369 aa25■■□□□ 1.59
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SEMA3B-204ENST00000433753 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA3B-204ENST00000433753 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA3B-204ENST00000433753 PTPRKQ15262 1439 aa24.92■■□□□ 1.58
SEMA3B-204ENST00000433753 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA3B-204ENST00000433753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.88■■□□□ 1.57
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SEMA3B-204ENST00000433753 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-204ENST00000433753 ARID3CA6NKF2 412 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA3B-204ENST00000433753 SAMD9Q5K651 1589 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA3B-204ENST00000433753 NCOA2Q15596 1464 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA3B-204ENST00000433753 GRIN2BQ13224 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
SEMA3B-204ENST00000433753 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.81■■□□□ 1.56
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SEMA3B-204ENST00000433753 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
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SEMA3B-204ENST00000433753 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.77■■□□□ 1.56
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SEMA3B-204ENST00000433753 HFM1A2PYH4 1435 aa24.76■■□□□ 1.55
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SEMA3B-204ENST00000433753 TONSLQ96HA7 1378 aa24.74■■□□□ 1.55
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SEMA3B-204ENST00000433753 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.72■■□□□ 1.55
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SEMA3B-204ENST00000433753 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.67■■□□□ 1.54
SEMA3B-204ENST00000433753 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.65■■□□□ 1.54
SEMA3B-204ENST00000433753 TRIM52Q96A61 297 aa24.64■■□□□ 1.54
SEMA3B-204ENST00000433753 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 PBRM1Q86U86 1689 aa24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 IQGAP2Q13576 1575 aa24.6■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 ARHGEF11O15085 1522 aa24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SEMA3B-204ENST00000433753 ANP32CO43423 234 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 FOXD1Q16676 465 aa24.57■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 ADAMTS12P58397 1594 aa24.55■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 HECW1Q76N89 1606 aa24.54■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 BCANQ96GW7 911 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 KDM6BO15054 1643 aa24.53■■□□□ 1.52
SEMA3B-204ENST00000433753 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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SEMA3B-204ENST00000433753 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.35■■□□□ 1.49
SEMA3B-204ENST00000433753 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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SEMA3B-204ENST00000433753 ABCC5O15440 1437 aa24.32■■□□□ 1.48
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