RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373030.7

IFT52-201, Transcript of intraflagellar transport 52, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFT52, Length 1,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52-201ENST00000373030 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
IFT52-201ENST00000373030 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.65■■□□□ 1.22
IFT52-201ENST00000373030 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
IFT52-201ENST00000373030 WDR97A6NE52 1622 aa22.62■■□□□ 1.21
IFT52-201ENST00000373030 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.62■■□□□ 1.21
IFT52-201ENST00000373030 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.58■■□□□ 1.21
IFT52-201ENST00000373030 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
IFT52-201ENST00000373030 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.58■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 MIER1Q8N108 512 aa22.56■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.56■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.53■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 NESP48681 1621 aa22.53■■□□□ 1.2
IFT52-201ENST00000373030 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.51■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.5■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.5■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 MAPKBP1O60336 1514 aa22.49■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.49■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.49■■□□□ 1.19
IFT52-201ENST00000373030 SAMD9Q5K651 1589 aa22.44■■□□□ 1.18
IFT52-201ENST00000373030 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.43■■□□□ 1.18
IFT52-201ENST00000373030 FMN1Q68DA7 1419 aa22.42■■□□□ 1.18
IFT52-201ENST00000373030 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.4■■□□□ 1.18
IFT52-201ENST00000373030 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.38■■□□□ 1.17
IFT52-201ENST00000373030 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
IFT52-201ENST00000373030 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
IFT52-201ENST00000373030 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.33■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.31■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 GRIN2BQ13224 1484 aa22.3■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 ITGAEP38570 1179 aa22.29■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 P3H3Q8IVL6 736 aa22.29■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.28■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.28■■□□□ 1.16
IFT52-201ENST00000373030 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
IFT52-201ENST00000373030 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
IFT52-201ENST00000373030 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
IFT52-201ENST00000373030 ARHGEF11O15085 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
IFT52-201ENST00000373030 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.19■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 HFM1A2PYH4 1435 aa22.17■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 PBRM1Q86U86 1689 aa22.17■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 NCOA2Q15596 1464 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.15■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.14■■□□□ 1.14
IFT52-201ENST00000373030 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.14■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.13■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 PTPRKQ15262 1439 aa22.12■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 UACAQ9BZF9 1416 aa22.1■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.08■■□□□ 1.13
IFT52-201ENST00000373030 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 HECW1Q76N89 1606 aa22.07■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 IQGAP2Q13576 1575 aa22.07■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 NAIPQ13075 1403 aa22.06■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.06■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.05■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.05■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 AKNAQ7Z591 1439 aa22.03■■□□□ 1.12
IFT52-201ENST00000373030 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22■■□□□ 1.11
IFT52-201ENST00000373030 WDR62O43379 1518 aa21.99■■□□□ 1.11
IFT52-201ENST00000373030 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
IFT52-201ENST00000373030 MIA2Q96PC5 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
IFT52-201ENST00000373030 IFT140Q96RY7 1462 aa21.96■■□□□ 1.11
IFT52-201ENST00000373030 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT52-201ENST00000373030 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.89■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 TONSLQ96HA7 1378 aa21.88■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 CCER2I3L3R5 266 aa21.85■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 KIAA0556O60303 1618 aa21.85■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 DISP1Q96F81 1524 aa21.84■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
IFT52-201ENST00000373030 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 ROCK1Q13464 1354 aa21.81■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 KCNH8Q96L42 1107 aa21.78■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 KDM6BO15054 1643 aa21.78■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 GRIN2AQ12879 1464 aa21.77■■□□□ 1.08
IFT52-201ENST00000373030 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.77■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 DAPK1P53355 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.71■■□□□ 1.07
IFT52-201ENST00000373030 ABCC5O15440 1437 aa21.69■■□□□ 1.06
IFT52-201ENST00000373030 ANP32CO43423 234 aa21.68■■□□□ 1.06
IFT52-201ENST00000373030 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.67■■□□□ 1.06
IFT52-201ENST00000373030 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.66■■□□□ 1.06
IFT52-201ENST00000373030 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
IFT52-201ENST00000373030 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
IFT52-201ENST00000373030 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT52-201ENST00000373030 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT52-201ENST00000373030 SYNJ2O15056 1496 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT52-201ENST00000373030 CEP170Q5SW79 1584 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms