RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 CLIP1P30622 1438 aa24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP162Q5TB80 1403 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EEA1Q15075 1411 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA3Q08378 1498 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RGS3P49796 1198 aa24.28■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.17■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 CCER2I3L3R5 266 aa24.16■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPY4P0CV99 314 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPY10P0CW01 314 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
AMIGO1-202ENST00000369864 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.07■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 PLCB2Q00722 1185 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 NACADO15069 1562 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CASC1Q6TDU7 716 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF27Q86VH2 1401 aa23.97■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 CFAP53Q96M91 514 aa23.97■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 NEUROD2Q15784 382 aa23.96■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 RGL3Q3MIN7 710 aa23.96■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 HSCBQ8IWL3 235 aa23.95■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CDCA8Q53HL2 280 aa23.93■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 SOGA1O94964 1423 aa23.91■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 MS4A1P11836 297 aa23.83■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.82■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.78■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 NRDCO43847 1150 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID3AQ99856 593 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GBP4Q96PP9 640 aa23.74■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 USP35Q9P2H5 1018 aa23.73■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 NUDCQ9Y266 331 aa23.72■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNH8Q96L42 1107 aa23.7■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.7■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 PTMSP20962 102 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.67■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.67■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.66■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCC8Q09428 1581 aa23.65■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 DRC7Q8IY82 874 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms