RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.54■■□□□ 1.84
UBQLN4-201ENST00000368309 TIAM1Q13009 1591 aa26.52■■□□□ 1.84
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.51■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.51■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.49■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.48■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.48■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
UBQLN4-201ENST00000368309 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.45■■□□□ 1.82
UBQLN4-201ENST00000368309 MAP3K1Q13233 1512 aa26.45■■□□□ 1.82
UBQLN4-201ENST00000368309 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UBQLN4-201ENST00000368309 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBQLN4-201ENST00000368309 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UBQLN4-201ENST00000368309 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.32■■□□□ 1.8
UBQLN4-201ENST00000368309 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.3■■□□□ 1.8
UBQLN4-201ENST00000368309 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.27■■□□□ 1.8
UBQLN4-201ENST00000368309 CUL7Q14999 1698 aa26.27■■□□□ 1.8
UBQLN4-201ENST00000368309 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.25■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.25■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.24■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.23■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.23■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 MAPKBP1O60336 1514 aa26.23■■□□□ 1.79
UBQLN4-201ENST00000368309 FMN1Q68DA7 1419 aa26.2■■□□□ 1.78
UBQLN4-201ENST00000368309 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.783e-8■■■■■ 27.2
UBQLN4-201ENST00000368309 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.17■■□□□ 1.78
UBQLN4-201ENST00000368309 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
UBQLN4-201ENST00000368309 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.15■■□□□ 1.78
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR97A6NE52 1622 aa26.14■■□□□ 1.78
UBQLN4-201ENST00000368309 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.12■■□□□ 1.77
UBQLN4-201ENST00000368309 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.11■■□□□ 1.77
UBQLN4-201ENST00000368309 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.07■■□□□ 1.76
UBQLN4-201ENST00000368309 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.06■■□□□ 1.76
UBQLN4-201ENST00000368309 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.765e-7■■■□□ 14.8
UBQLN4-201ENST00000368309 SAMD9Q5K651 1589 aa26■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 PTPRKQ15262 1439 aa25.98■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 GRIN2BQ13224 1484 aa25.97■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 ARID3CA6NKF2 412 aa25.96■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 NCOA2Q15596 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
UBQLN4-201ENST00000368309 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 KCNH8Q96L42 1107 aa25.92■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.92■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.91■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.9■■□□□ 1.74
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.88■■□□□ 1.73
UBQLN4-201ENST00000368309 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.88■■□□□ 1.73
UBQLN4-201ENST00000368309 HFM1A2PYH4 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
UBQLN4-201ENST00000368309 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.85■■□□□ 1.73
UBQLN4-201ENST00000368309 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.83■■□□□ 1.73
UBQLN4-201ENST00000368309 NAIPQ13075 1403 aa25.82■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 TONSLQ96HA7 1378 aa25.81■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.8■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.8■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 UACAQ9BZF9 1416 aa25.8■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.78■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 PBRM1Q86U86 1689 aa25.78■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 IQGAP2Q13576 1575 aa25.77■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
UBQLN4-201ENST00000368309 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.76■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 ADAMTS12P58397 1594 aa25.74■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 TRIM52Q96A61 297 aa25.72■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGEF11O15085 1522 aa25.7■■□□□ 1.71
UBQLN4-201ENST00000368309 HECW1Q76N89 1606 aa25.68■■□□□ 1.7
UBQLN4-201ENST00000368309 IFT140Q96RY7 1462 aa25.64■■□□□ 1.7
UBQLN4-201ENST00000368309 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
UBQLN4-201ENST00000368309 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UBQLN4-201ENST00000368309 WDR62O43379 1518 aa25.6■■□□□ 1.69
UBQLN4-201ENST00000368309 ANP32CO43423 234 aa25.58■■□□□ 1.69
UBQLN4-201ENST00000368309 FOXD1Q16676 465 aa25.58■■□□□ 1.69
UBQLN4-201ENST00000368309 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.57■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 FBLN2P98095 1184 aa25.57■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.56■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 MIA2Q96PC5 1412 aa25.56■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 DISP1Q96F81 1524 aa25.55■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 KDM6BO15054 1643 aa25.53■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
UBQLN4-201ENST00000368309 GRIN2AQ12879 1464 aa25.5■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 ERCC6Q03468 1493 aa25.49■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.48■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 KIAA0556O60303 1618 aa25.48■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 CCER2I3L3R5 266 aa25.46■■□□□ 1.67
UBQLN4-201ENST00000368309 AKNAQ7Z591 1439 aa25.45■■□□□ 1.66
UBQLN4-201ENST00000368309 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.44■■□□□ 1.66
UBQLN4-201ENST00000368309 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBQLN4-201ENST00000368309 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
UBQLN4-201ENST00000368309 DAPK1P53355 1430 aa25.43■■□□□ 1.66
UBQLN4-201ENST00000368309 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms