RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 MRS2Q9HD23 443 aa28.1■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 SLC24A1O60721 1099 aa28.1■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 ABCC8Q09428 1581 aa28.08■■■□□ 2.09
NISCH-201ENST00000345716 BCL11AQ9H165 835 aa28.07■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 CUX2O14529 1486 aa28.04■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 KCNH8Q96L42 1107 aa28.04■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.04■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.08
NISCH-201ENST00000345716 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
NISCH-201ENST00000345716 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.95■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.94■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 WIZO95785 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 SMARCA2P51531 1590 aa27.93■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.92■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.9■■■□□ 2.06
NISCH-201ENST00000345716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
NISCH-201ENST00000345716 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.052e-6■■■■■ 54.5
NISCH-201ENST00000345716 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.86■■■□□ 2.05
NISCH-201ENST00000345716 RGL3Q3MIN7 710 aa27.85■■■□□ 2.05
NISCH-201ENST00000345716 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.85■■■□□ 2.05
NISCH-201ENST00000345716 ERCC6Q03468 1493 aa27.84■■■□□ 2.05
NISCH-201ENST00000345716 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
NISCH-201ENST00000345716 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
NISCH-201ENST00000345716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
NISCH-201ENST00000345716 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.69■■■□□ 2.02
NISCH-201ENST00000345716 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.62■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.6■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.59■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.58■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.58■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 SMARCA4P51532 1647 aa27.58■■■□□ 2.01
NISCH-201ENST00000345716 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.55■■■□□ 2
NISCH-201ENST00000345716 CDCA8Q53HL2 280 aa27.54■■■□□ 2
NISCH-201ENST00000345716 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.53■■■□□ 2
NISCH-201ENST00000345716 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.52■■■□□ 2
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 FMN1Q68DA7 1419 aa27.48■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.45■■□□□ 1.99
NISCH-201ENST00000345716 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.43■■□□□ 1.98
NISCH-201ENST00000345716 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.41■■□□□ 1.98
NISCH-201ENST00000345716 CFAP53Q96M91 514 aa27.36■■□□□ 1.97
NISCH-201ENST00000345716 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.36■■□□□ 1.97
NISCH-201ENST00000345716 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.35■■□□□ 1.97
NISCH-201ENST00000345716 FOXD1Q16676 465 aa27.34■■□□□ 1.97
NISCH-201ENST00000345716 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NISCH-201ENST00000345716 NBR1Q14596 966 aa27.32■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 PKD2Q13563 968 aa27.32■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.27■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 CCER2I3L3R5 266 aa27.27■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.96
NISCH-201ENST00000345716 TMF1P82094 1093 aa27.24■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.23■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 KANK1Q14678 1352 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 NEUROD2Q15784 382 aa27.21■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 C14orf37Q86TY3 774 aa27.21■■□□□ 1.95
NISCH-201ENST00000345716 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.2■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 POGKQ9P215 609 aa27.2■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.17■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.16■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHG5O94827 1062 aa27.15■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 NUP155O75694 1391 aa27.15■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.14■■□□□ 1.94
NISCH-201ENST00000345716 NUDCQ9Y266 331 aa27.11■■□□□ 1.93
NISCH-201ENST00000345716 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.1■■□□□ 1.93
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.08■■□□□ 1.93
NISCH-201ENST00000345716 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.07■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.05■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.05■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 GGT6Q6P531 493 aa27.04■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.03■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 JPH4Q96JJ6 628 aa27.03■■□□□ 1.92
NISCH-201ENST00000345716 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.923e-7■■■□□ 19.2
NISCH-201ENST00000345716 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 BECN1Q14457 450 aa27■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 IGF1RP08069 1367 aa26.99■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 ARXQ96QS3 562 aa26.97■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.97■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 MLECQ14165 292 aa26.95■■□□□ 1.91
NISCH-201ENST00000345716 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
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