RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322054.9

EHD3-201, Transcript of EH domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD3, Length 4,636 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3-201ENST00000322054 NEFMP07197 916 aa22.03■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
EHD3-201ENST00000322054 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.01■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 TMC1Q8TDI8 760 aa22.01■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 WIZO95785 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 MRS2Q9HD23 443 aa22■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.96■■□□□ 1.11
EHD3-201ENST00000322054 SMARCA2P51531 1590 aa21.95■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 BCL11AQ9H165 835 aa21.94■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 SLC24A1O60721 1099 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.92■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 RGL3Q3MIN7 710 aa21.89■■□□□ 1.1
EHD3-201ENST00000322054 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
EHD3-201ENST00000322054 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD3-201ENST00000322054 ERCC6Q03468 1493 aa21.87■■□□□ 1.09
EHD3-201ENST00000322054 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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EHD3-201ENST00000322054 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.78■■□□□ 1.08
EHD3-201ENST00000322054 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
EHD3-201ENST00000322054 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.74■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.73■■□□□ 1.07
EHD3-201ENST00000322054 SMARCA4P51532 1647 aa21.7■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.7■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.7■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.67■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.65■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.64■■□□□ 1.06
EHD3-201ENST00000322054 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.61■■□□□ 1.05
EHD3-201ENST00000322054 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.61■■□□□ 1.05
EHD3-201ENST00000322054 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
EHD3-201ENST00000322054 FMN1Q68DA7 1419 aa21.57■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.56■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.52■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 FOXD1Q16676 465 aa21.52■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.52■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.52■■□□□ 1.04
EHD3-201ENST00000322054 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
EHD3-201ENST00000322054 CDCA8Q53HL2 280 aa21.51■■□□□ 1.03
EHD3-201ENST00000322054 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.47■■□□□ 1.03
EHD3-201ENST00000322054 PKD2Q13563 968 aa21.47■■□□□ 1.03
EHD3-201ENST00000322054 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
EHD3-201ENST00000322054 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
EHD3-201ENST00000322054 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.42■■□□□ 1.02
EHD3-201ENST00000322054 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.39■■□□□ 1.02
EHD3-201ENST00000322054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
EHD3-201ENST00000322054 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
EHD3-201ENST00000322054 CFAP53Q96M91 514 aa21.36■■□□□ 1.01
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EHD3-201ENST00000322054 JPH4Q96JJ6 628 aa21.34■■□□□ 1.01
EHD3-201ENST00000322054 NEUROD2Q15784 382 aa21.33■■□□□ 1.01
EHD3-201ENST00000322054 NUP155O75694 1391 aa21.33■■□□□ 1.01
EHD3-201ENST00000322054 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 PLEKHG5O94827 1062 aa21.32■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 TMF1P82094 1093 aa21.32■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 CCER2I3L3R5 266 aa21.32■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 IGF1RP08069 1367 aa21.31■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.3■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 POGKQ9P215 609 aa21.3■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 C14orf37Q86TY3 774 aa21.29■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 GGT6Q6P531 493 aa21.28■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.28■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.28■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 KANK1Q14678 1352 aa21.28■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 NBR1Q14596 966 aa21.27■■□□□ 1
EHD3-201ENST00000322054 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
EHD3-201ENST00000322054 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
EHD3-201ENST00000322054 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.24■□□□□ 0.99
EHD3-201ENST00000322054 NCAPD3P42695 1498 aa21.24■□□□□ 0.99
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EHD3-201ENST00000322054 MLECQ14165 292 aa21.21■□□□□ 0.99
EHD3-201ENST00000322054 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.21■□□□□ 0.99
EHD3-201ENST00000322054 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.19■□□□□ 0.98
EHD3-201ENST00000322054 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.19■□□□□ 0.98
EHD3-201ENST00000322054 NUDCQ9Y266 331 aa21.19■□□□□ 0.98
EHD3-201ENST00000322054 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.17■□□□□ 0.98
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EHD3-201ENST00000322054 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.16■□□□□ 0.98
EHD3-201ENST00000322054 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 KIF3BO15066 747 aa21.14■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.12■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.12■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
EHD3-201ENST00000322054 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
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