RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
KCNS1-201ENST00000306117 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
KCNS1-201ENST00000306117 NACADO15069 1562 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNS1-201ENST00000306117 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
KCNS1-201ENST00000306117 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.02■□□□□ 0.96
KCNS1-201ENST00000306117 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.99■□□□□ 0.95
KCNS1-201ENST00000306117 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNS1-201ENST00000306117 MRS2Q9HD23 443 aa20.98■□□□□ 0.95
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
KCNS1-201ENST00000306117 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
KCNS1-201ENST00000306117 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.92■□□□□ 0.94
KCNS1-201ENST00000306117 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 FBLN2P98095 1184 aa20.87■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.86■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 NEFMP07197 916 aa20.85■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
KCNS1-201ENST00000306117 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.83■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 TMC1Q8TDI8 760 aa20.81■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.8■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.79■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 KIF27Q86VH2 1401 aa20.78■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
KCNS1-201ENST00000306117 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.74■□□□□ 0.91
KCNS1-201ENST00000306117 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
KCNS1-201ENST00000306117 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
KCNS1-201ENST00000306117 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.7■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.66■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD1Q16676 465 aa20.65■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
KCNS1-201ENST00000306117 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.63■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.61■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 SLC24A1O60721 1099 aa20.6■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 CUX2O14529 1486 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 CCER2I3L3R5 266 aa20.58■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
KCNS1-201ENST00000306117 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.57■□□□□ 0.88
KCNS1-201ENST00000306117 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
KCNS1-201ENST00000306117 BECN1Q14457 450 aa20.52■□□□□ 0.87
KCNS1-201ENST00000306117 SMARCA2P51531 1590 aa20.52■□□□□ 0.87
KCNS1-201ENST00000306117 SMARCA4P51532 1647 aa20.5■□□□□ 0.87
KCNS1-201ENST00000306117 RGL3Q3MIN7 710 aa20.46■□□□□ 0.87
KCNS1-201ENST00000306117 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
KCNS1-201ENST00000306117 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
KCNS1-201ENST00000306117 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.44■□□□□ 0.86
KCNS1-201ENST00000306117 KIF21BO75037 1637 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNS1-201ENST00000306117 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNS1-201ENST00000306117 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 RGS3P49796 1198 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.38■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.37■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.35■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
KCNS1-201ENST00000306117 TSPY4P0CV99 314 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 TSPY10P0CW01 314 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.32■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.29■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 ARAP1Q96P48 1450 aa20.28■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 SYNJ1O43426 1573 aa20.27■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.27■□□□□ 0.84
KCNS1-201ENST00000306117 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
KCNS1-201ENST00000306117 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
KCNS1-201ENST00000306117 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
KCNS1-201ENST00000306117 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.21■□□□□ 0.83
KCNS1-201ENST00000306117 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.2■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 PKD2Q13563 968 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
KCNS1-201ENST00000306117 CCDC184Q52MB2 194 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 IGF1RP08069 1367 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 NEUROD2Q15784 382 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 ARID3AQ99856 593 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 PLCB2Q00722 1185 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 FMN1Q68DA7 1419 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 NUDCQ9Y266 331 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNS1-201ENST00000306117 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms