RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303004.4

CEBPB-201, Transcript of CCAAT enhancer binding protein beta, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CEBPB, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPB-201ENST00000303004 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CEBPB-201ENST00000303004 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.68■■■■□ 3.14
CEBPB-201ENST00000303004 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.65■■■■□ 3.14
CEBPB-201ENST00000303004 CUL7Q14999 1698 aa34.63■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 TOPBP1Q92547 1522 aa34.62■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 SETD5Q9C0A6 1442 aa34.6■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.59■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 MAPKBP1O60336 1514 aa34.59■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.59■■■■□ 3.13
CEBPB-201ENST00000303004 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
CEBPB-201ENST00000303004 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.53■■■■□ 3.12
CEBPB-201ENST00000303004 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.52■■■■□ 3.12
CEBPB-201ENST00000303004 ITGAEP38570 1179 aa34.48■■■■□ 3.11
CEBPB-201ENST00000303004 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.48■■■■□ 3.11
CEBPB-201ENST00000303004 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.43■■■■□ 3.1
CEBPB-201ENST00000303004 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.42■■■■□ 3.1
CEBPB-201ENST00000303004 WDR97A6NE52 1622 aa34.42■■■■□ 3.1
CEBPB-201ENST00000303004 FMN1Q68DA7 1419 aa34.4■■■■□ 3.1
CEBPB-201ENST00000303004 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.39■■■■□ 3.1
CEBPB-201ENST00000303004 NESP48681 1621 aa34.34■■■■□ 3.09
CEBPB-201ENST00000303004 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.3■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 P3H3Q8IVL6 736 aa34.29■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.29■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 SAMD9Q5K651 1589 aa34.27■■■■□ 3.08
CEBPB-201ENST00000303004 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CEBPB-201ENST00000303004 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.21■■■■□ 3.07
CEBPB-201ENST00000303004 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CEBPB-201ENST00000303004 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.15■■■■□ 3.06
CEBPB-201ENST00000303004 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.14■■■■□ 3.06
CEBPB-201ENST00000303004 GRIN2BQ13224 1484 aa34.11■■■■□ 3.05
CEBPB-201ENST00000303004 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.08■■■■□ 3.05
CEBPB-201ENST00000303004 HFM1A2PYH4 1435 aa34.08■■■■□ 3.05
CEBPB-201ENST00000303004 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.08■■■■□ 3.05
CEBPB-201ENST00000303004 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.06■■■■□ 3.04
CEBPB-201ENST00000303004 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CEBPB-201ENST00000303004 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.03■■■■□ 3.04
CEBPB-201ENST00000303004 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.01■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.01■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 UACAQ9BZF9 1416 aa34■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 NCOA2Q15596 1464 aa33.99■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.97■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 ARHGEF11O15085 1522 aa33.95■■■■□ 3.03
CEBPB-201ENST00000303004 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
CEBPB-201ENST00000303004 PTPRKQ15262 1439 aa33.92■■■■□ 3.02
CEBPB-201ENST00000303004 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
CEBPB-201ENST00000303004 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.9■■■■□ 3.02
CEBPB-201ENST00000303004 NAIPQ13075 1403 aa33.88■■■■□ 3.01
CEBPB-201ENST00000303004 MYT1Q01538 1121 aa33.87■■■■□ 3.01
CEBPB-201ENST00000303004 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CEBPB-201ENST00000303004 TONSLQ96HA7 1378 aa33.82■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 HECW1Q76N89 1606 aa33.81■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 AKNAQ7Z591 1439 aa33.78■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 CCER2I3L3R5 266 aa33.78■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 PBRM1Q86U86 1689 aa33.77■■■■□ 3
CEBPB-201ENST00000303004 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.75■■■□□ 2.99
CEBPB-201ENST00000303004 IQGAP2Q13576 1575 aa33.74■■■□□ 2.99
CEBPB-201ENST00000303004 KCNH8Q96L42 1107 aa33.72■■■□□ 2.99
CEBPB-201ENST00000303004 ADAMTS12P58397 1594 aa33.72■■■□□ 2.99
CEBPB-201ENST00000303004 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.71■■■□□ 2.99
CEBPB-201ENST00000303004 MIA2Q96PC5 1412 aa33.69■■■□□ 2.98
CEBPB-201ENST00000303004 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
CEBPB-201ENST00000303004 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.66■■■□□ 2.98
CEBPB-201ENST00000303004 ANP32CO43423 234 aa33.62■■■□□ 2.97
CEBPB-201ENST00000303004 WDR62O43379 1518 aa33.61■■■□□ 2.97
CEBPB-201ENST00000303004 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.6■■■□□ 2.97
CEBPB-201ENST00000303004 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.52■■■□□ 2.96
CEBPB-201ENST00000303004 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
CEBPB-201ENST00000303004 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
CEBPB-201ENST00000303004 IFT140Q96RY7 1462 aa33.47■■■□□ 2.95
CEBPB-201ENST00000303004 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
CEBPB-201ENST00000303004 ROCK1Q13464 1354 aa33.44■■■□□ 2.94
CEBPB-201ENST00000303004 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.43■■■□□ 2.94
CEBPB-201ENST00000303004 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.42■■■□□ 2.94
CEBPB-201ENST00000303004 KDM6BO15054 1643 aa33.39■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 KIAA0556O60303 1618 aa33.39■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.35■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 DISP1Q96F81 1524 aa33.35■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.33■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 DAPK1P53355 1430 aa33.33■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.32■■■□□ 2.93
CEBPB-201ENST00000303004 TRIM52Q96A61 297 aa33.3■■■□□ 2.92
CEBPB-201ENST00000303004 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
CEBPB-201ENST00000303004 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.27■■■□□ 2.92
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.92
CEBPB-201ENST00000303004 FKBP8Q14318 412 aa33.26■■■□□ 2.91
CEBPB-201ENST00000303004 ABCC5O15440 1437 aa33.25■■■□□ 2.91
CEBPB-201ENST00000303004 NEFLP07196 543 aa33.25■■■□□ 2.91
CEBPB-201ENST00000303004 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
CEBPB-201ENST00000303004 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.23■■■□□ 2.91
CEBPB-201ENST00000303004 GRIN2AQ12879 1464 aa33.23■■■□□ 2.91
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