RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
USP43-201ENST00000285199 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
USP43-201ENST00000285199 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
USP43-201ENST00000285199 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
USP43-201ENST00000285199 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.25■□□□□ 0.99
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USP43-201ENST00000285199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.2■□□□□ 0.98
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USP43-201ENST00000285199 FBLN2P98095 1184 aa21.19■□□□□ 0.98
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USP43-201ENST00000285199 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.48■□□□□ 0.87
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USP43-201ENST00000285199 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.41■□□□□ 0.86
USP43-201ENST00000285199 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.4■□□□□ 0.86
USP43-201ENST00000285199 KIF21BO75037 1637 aa20.38■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.36■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 ARID3AQ99856 593 aa20.35■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.35■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.34■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 SKAP1Q86WV1 359 aa20.34■□□□□ 0.85
USP43-201ENST00000285199 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.34■□□□□ 0.85
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