RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 MRS2Q9HD23 443 aa22.27■■□□□ 1.16
GPC1-201ENST00000264039 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 TONSLQ96HA7 1378 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 IL27Q8NEV9 243 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.23■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 NEFMP07197 916 aa22.21■■□□□ 1.15
GPC1-201ENST00000264039 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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GPC1-201ENST00000264039 CCER2I3L3R5 266 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-201ENST00000264039 ARXQ96QS3 562 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-201ENST00000264039 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.15■■□□□ 1.14
GPC1-201ENST00000264039 EEA1Q15075 1411 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 NACADO15069 1562 aa22.07■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 WIZO95785 1651 aa22.06■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.04■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.03■■□□□ 1.12
GPC1-201ENST00000264039 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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GPC1-201ENST00000264039 ARID3CA6NKF2 412 aa21.89■■□□□ 1.1
GPC1-201ENST00000264039 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.89■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.89■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 CCDC184Q52MB2 194 aa21.85■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 TMC1Q8TDI8 760 aa21.84■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 SLC4A3P48751 1232 aa21.84■■□□□ 1.09
GPC1-201ENST00000264039 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.84■■□□□ 1.09
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GPC1-201ENST00000264039 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.82■■□□□ 1.08
GPC1-201ENST00000264039 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.8■■□□□ 1.08
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GPC1-201ENST00000264039 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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GPC1-201ENST00000264039 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.67■■□□□ 1.06
GPC1-201ENST00000264039 RGS3P49796 1198 aa21.62■■□□□ 1.05
GPC1-201ENST00000264039 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
GPC1-201ENST00000264039 PDE4AP27815 886 aa21.62■■□□□ 1.05
GPC1-201ENST00000264039 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
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GPC1-201ENST00000264039 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.59■■□□□ 1.05
GPC1-201ENST00000264039 AKNAQ7Z591 1439 aa21.58■■□□□ 1.04
GPC1-201ENST00000264039 SKAP1Q86WV1 359 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-201ENST00000264039 NUDCQ9Y266 331 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-201ENST00000264039 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.57■■□□□ 1.04
GPC1-201ENST00000264039 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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GPC1-201ENST00000264039 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.44■■□□□ 1.02
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GPC1-201ENST00000264039 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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GPC1-201ENST00000264039 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.4■■□□□ 1.02
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GPC1-201ENST00000264039 KIF27Q86VH2 1401 aa21.33■■□□□ 1
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GPC1-201ENST00000264039 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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