RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262805.16

PDE4C-201, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 2,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-201ENST00000262805 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.46■■□□□ 1.51
PDE4C-201ENST00000262805 MAP3K1Q13233 1512 aa24.46■■□□□ 1.51
PDE4C-201ENST00000262805 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.46■■□□□ 1.51
PDE4C-201ENST00000262805 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.45■■□□□ 1.5
PDE4C-201ENST00000262805 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.44■■□□□ 1.5
PDE4C-201ENST00000262805 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PDE4C-201ENST00000262805 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.42■■□□□ 1.5
PDE4C-201ENST00000262805 MAPKBP1O60336 1514 aa24.39■■□□□ 1.5
PDE4C-201ENST00000262805 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.38■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.37■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 TOPBP1Q92547 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.36■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.35■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PDE4C-201ENST00000262805 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PDE4C-201ENST00000262805 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.31■■□□□ 1.48
PDE4C-201ENST00000262805 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.28■■□□□ 1.48
PDE4C-201ENST00000262805 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.23■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 ERCC6Q03468 1493 aa24.22■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.22■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 CUL7Q14999 1698 aa24.22■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.22■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.21■■□□□ 1.47
PDE4C-201ENST00000262805 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.2■■□□□ 1.46
PDE4C-201ENST00000262805 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PDE4C-201ENST00000262805 WDR97A6NE52 1622 aa24.16■■□□□ 1.46
PDE4C-201ENST00000262805 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.463e-6■■■■□ 24.7
PDE4C-201ENST00000262805 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PDE4C-201ENST00000262805 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.11■■□□□ 1.45
PDE4C-201ENST00000262805 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.1■■□□□ 1.45
PDE4C-201ENST00000262805 KCNH8Q96L42 1107 aa24.09■■□□□ 1.45
PDE4C-201ENST00000262805 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.08■■□□□ 1.45
PDE4C-201ENST00000262805 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.07■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 FMN1Q68DA7 1419 aa24.07■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.06■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 SAMD9Q5K651 1589 aa24.03■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.02■■□□□ 1.44
PDE4C-201ENST00000262805 PTPRKQ15262 1439 aa24.01■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.01■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 WDR62O43379 1518 aa24■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 GRIN2BQ13224 1484 aa23.96■■□□□ 1.43
PDE4C-201ENST00000262805 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 NCOA2Q15596 1464 aa23.93■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.9■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.9■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 HFM1A2PYH4 1435 aa23.89■■□□□ 1.42
PDE4C-201ENST00000262805 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.89■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.87■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 NAIPQ13075 1403 aa23.85■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 UACAQ9BZF9 1416 aa23.84■■□□□ 1.41
PDE4C-201ENST00000262805 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.83■■□□□ 1.4
PDE4C-201ENST00000262805 TONSLQ96HA7 1378 aa23.81■■□□□ 1.4
PDE4C-201ENST00000262805 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.8■■□□□ 1.4
PDE4C-201ENST00000262805 ARHGEF11O15085 1522 aa23.78■■□□□ 1.4
PDE4C-201ENST00000262805 PBRM1Q86U86 1689 aa23.77■■□□□ 1.4
PDE4C-201ENST00000262805 IFT140Q96RY7 1462 aa23.74■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.74■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.73■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.72■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 ARID3CA6NKF2 412 aa23.71■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 IQGAP2Q13576 1575 aa23.7■■□□□ 1.39
PDE4C-201ENST00000262805 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 HECW1Q76N89 1606 aa23.69■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 ADAMTS12P58397 1594 aa23.68■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 KDM6BO15054 1643 aa23.68■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 ANP32CO43423 234 aa23.65■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.64■■□□□ 1.38
PDE4C-201ENST00000262805 CCER2I3L3R5 266 aa23.61■■□□□ 1.37
PDE4C-201ENST00000262805 TRIM52Q96A61 297 aa23.61■■□□□ 1.37
PDE4C-201ENST00000262805 BCANQ96GW7 911 aa23.6■■□□□ 1.37
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 FKBP8Q14318 412 aa23.56■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.56■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 FOXD1Q16676 465 aa23.53■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 MIA2Q96PC5 1412 aa23.53■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 AKNAQ7Z591 1439 aa23.53■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PDE4C-201ENST00000262805 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.51■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.48■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 DISP1Q96F81 1524 aa23.48■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 KIAA0556O60303 1618 aa23.46■■□□□ 1.35
PDE4C-201ENST00000262805 DAPK1P53355 1430 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-201ENST00000262805 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-201ENST00000262805 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4C-201ENST00000262805 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms