RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
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CSDE1-201ENST00000261443 CUX2O14529 1486 aa10.09□□□□□ -0.79
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CSDE1-201ENST00000261443 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.79□□□□□ -0.84
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CSDE1-201ENST00000261443 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.79□□□□□ -0.84
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CSDE1-201ENST00000261443 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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CSDE1-201ENST00000261443 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.75□□□□□ -0.85
CSDE1-201ENST00000261443 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.75□□□□□ -0.85
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CSDE1-201ENST00000261443 NUDCQ9Y266 331 aa9.71□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.71□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 SAMD9Q5K651 1589 aa9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 GSE1Q14687 1217 aa9.69□□□□□ -0.86
CSDE1-201ENST00000261443 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
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