RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHG5O94827 1062 aa7.51□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.5□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.49□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
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LMO3-201ENST00000261169 NBR1Q14596 966 aa7.48□□□□□ -1.21
LMO3-201ENST00000261169 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.47□□□□□ -1.21
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LMO3-201ENST00000261169 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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LMO3-201ENST00000261169 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.43□□□□□ -1.22
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LMO3-201ENST00000261169 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 EEA1Q15075 1411 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 NEUROD2Q15784 382 aa7.41□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.4□□□□□ -1.22
LMO3-201ENST00000261169 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
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LMO3-201ENST00000261169 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SMARCA2P51531 1590 aa7.39□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.38□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.38□□□□□ -1.23
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LMO3-201ENST00000261169 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 CUX2O14529 1486 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.37□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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LMO3-201ENST00000261169 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SMARCA4P51532 1647 aa7.36□□□□□ -1.23
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LMO3-201ENST00000261169 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.36□□□□□ -1.23
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LMO3-201ENST00000261169 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.34□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LMO3-201ENST00000261169 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 C14orf37Q86TY3 774 aa7.33□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 A0A0G2JS52 829 aa7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 RGS3P49796 1198 aa7.31□□□□□ -1.24
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LMO3-201ENST00000261169 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 PKD2Q13563 968 aa7.31□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 MLECQ14165 292 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 SOX12O15370 315 aa7.3□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 WIZO95785 1651 aa7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 NCAPD3P42695 1498 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 GGT6Q6P531 493 aa7.28□□□□□ -1.24
LMO3-201ENST00000261169 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 MPHOSPH9Q99550 1183 aa7.27□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 ERCC6Q03468 1493 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.26□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 STK26Q9P289 416 aa7.25□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 POGKQ9P215 609 aa7.25□□□□□ -1.25
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LMO3-201ENST00000261169 HMGXB3Q12766 1538 aa7.23□□□□□ -1.25
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LMO3-201ENST00000261169 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.22□□□□□ -1.25
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LMO3-201ENST00000261169 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
LMO3-201ENST00000261169 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 TMF1P82094 1093 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CDCA8Q53HL2 280 aa7.21□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-201ENST00000261169 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.19□□□□□ -1.26
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