RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-201ENST00000256413 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CTIF-201ENST00000256413 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CTIF-201ENST00000256413 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CTIF-201ENST00000256413 SLC24A1O60721 1099 aa21.11■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.1■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 P3H3Q8IVL6 736 aa21.08■□□□□ 0.97
CTIF-201ENST00000256413 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 40.3
CTIF-201ENST00000256413 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CTIF-201ENST00000256413 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CTIF-201ENST00000256413 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CTIF-201ENST00000256413 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.91■□□□□ 0.94
CTIF-201ENST00000256413 RGS3P49796 1198 aa20.9■□□□□ 0.94
CTIF-201ENST00000256413 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CTIF-201ENST00000256413 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.87■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 CCER2I3L3R5 266 aa20.87■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.86■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 ARID3CA6NKF2 412 aa20.84■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
CTIF-201ENST00000256413 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.83■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.81■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 CLIP1P30622 1438 aa20.8■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 CEP162Q5TB80 1403 aa20.78■□□□□ 0.92
CTIF-201ENST00000256413 PLCB2Q00722 1185 aa20.77■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.74■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.74■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 USP35Q9P2H5 1018 aa20.73■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 HSCBQ8IWL3 235 aa20.72■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 ARID3AQ99856 593 aa20.71■□□□□ 0.91
CTIF-201ENST00000256413 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.69■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 CASC1Q6TDU7 716 aa20.69■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.68■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.66■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CTIF-201ENST00000256413 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.63■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.63■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.63■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 PTMSP20962 102 aa20.61■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 NRDCO43847 1150 aa20.59■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 GSE1Q14687 1217 aa20.59■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA3Q08378 1498 aa20.58■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 GBP4Q96PP9 640 aa20.58■□□□□ 0.89
CTIF-201ENST00000256413 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.57■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.56■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 EEA1Q15075 1411 aa20.54■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.53■□□□□ 0.88
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.49■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 MS4A1P11836 297 aa20.48■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.872e-6■■□□□ 12.8
CTIF-201ENST00000256413 DRC7Q8IY82 874 aa20.47■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 CFAP53Q96M91 514 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.46■□□□□ 0.87
CTIF-201ENST00000256413 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.45■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 NEUROD2Q15784 382 aa20.43■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 CDCA8Q53HL2 280 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 TSPY4P0CV99 314 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 TSPY10P0CW01 314 aa20.41■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 NUDCQ9Y266 331 aa20.4■□□□□ 0.86
CTIF-201ENST00000256413 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 CFAP44Q96MT7 982 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 PDE4AP27815 886 aa20.34■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTIF-201ENST00000256413 ERCC6Q03468 1493 aa20.33■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.32■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.3■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 MCCP23508 829 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 RGL3Q3MIN7 710 aa20.29■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 C14orf37Q86TY3 774 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 SLC4A3P48751 1232 aa20.28■□□□□ 0.84
CTIF-201ENST00000256413 KCNH8Q96L42 1107 aa20.27■□□□□ 0.84
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