RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
ZBED3-201ENST00000255198 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ZBED3-201ENST00000255198 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.06■■□□□ 1.92
ZBED3-201ENST00000255198 TSPY4P0CV99 314 aa27.05■■□□□ 1.92
ZBED3-201ENST00000255198 TSPY10P0CW01 314 aa27.05■■□□□ 1.92
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
ZBED3-201ENST00000255198 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
ZBED3-201ENST00000255198 BECN1Q14457 450 aa26.96■■□□□ 1.91
ZBED3-201ENST00000255198 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
ZBED3-201ENST00000255198 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ZBED3-201ENST00000255198 KCNH8Q96L42 1107 aa26.9■■□□□ 1.9
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.9■■□□□ 1.9
ZBED3-201ENST00000255198 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.88■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.87■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 RGL3Q3MIN7 710 aa26.86■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.84■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 NPHP1O15259 732 aa26.83■■□□□ 1.89
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 CASC1Q6TDU7 716 aa26.81■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 MIER1Q8N108 512 aa26.81■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.8■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 NEUROD2Q15784 382 aa26.79■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ZBED3-201ENST00000255198 PLCB2Q00722 1185 aa26.76■■□□□ 1.87
ZBED3-201ENST00000255198 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP53Q96M91 514 aa26.75■■□□□ 1.87
ZBED3-201ENST00000255198 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ZBED3-201ENST00000255198 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
ZBED3-201ENST00000255198 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.66■■□□□ 1.86
ZBED3-201ENST00000255198 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.66■■□□□ 1.86
ZBED3-201ENST00000255198 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 SCRIBQ14160 1630 aa26.64■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.62■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 FGD1P98174 961 aa26.6■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 RGS3P49796 1198 aa26.6■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 CLSTN1O94985 981 aa26.59■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ZBED3-201ENST00000255198 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA2Q08379 1002 aa26.54■■□□□ 1.84
ZBED3-201ENST00000255198 KCNJ4P48050 445 aa26.53■■□□□ 1.84
ZBED3-201ENST00000255198 POGKQ9P215 609 aa26.53■■□□□ 1.84
ZBED3-201ENST00000255198 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ZBED3-201ENST00000255198 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.51■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.5■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.48■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 CDCA8Q53HL2 280 aa26.47■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 SOX12O15370 315 aa26.46■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 NUDCQ9Y266 331 aa26.45■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
ZBED3-201ENST00000255198 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.37■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 CLIP1P30622 1438 aa26.36■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.35■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.35■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.35■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ZBED3-201ENST00000255198 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ZBED3-201ENST00000255198 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
ZBED3-201ENST00000255198 NRDCO43847 1150 aa26.28■■□□□ 1.8
ZBED3-201ENST00000255198 DRC7Q8IY82 874 aa26.28■■□□□ 1.8
ZBED3-201ENST00000255198 MLECQ14165 292 aa26.25■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 HSCBQ8IWL3 235 aa26.23■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 APBB1O00213 710 aa26.22■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.2■■□□□ 1.79
ZBED3-201ENST00000255198 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.2■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.18■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 MS4A1P11836 297 aa26.16■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 MCCP23508 829 aa26.15■■□□□ 1.78
ZBED3-201ENST00000255198 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
ZBED3-201ENST00000255198 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
ZBED3-201ENST00000255198 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.07■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.07■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 PDE4CQ08493 712 aa26.06■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 MORC1Q86VD1 984 aa26.06■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 TMF1P82094 1093 aa26.06■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 ARID3AQ99856 593 aa26.05■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 STK26Q9P289 416 aa26.04■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.02■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
ZBED3-201ENST00000255198 CEP162Q5TB80 1403 aa25.99■■□□□ 1.75
ZBED3-201ENST00000255198 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.98■■□□□ 1.75
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