RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erich3F6QRE9 1637 aa32.16■■■□□ 2.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa32.15■■■□□ 2.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BlmO88700 1416 aa32.14■■■□□ 2.74
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcf11G3X9Z4 1553 aa32.08■■■□□ 2.73
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slx4Q6P1D7 1565 aa32.07■■■□□ 2.72
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa32.06■■■□□ 2.72
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cux2P70298 1426 aa31.97■■■□□ 2.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmod2Q3UHZ5 550 aa31.95■■■□□ 2.71
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cux1P53564 1515 aa31.92■■■□□ 2.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Carmil1Q6EDY6 1374 aa31.85■■■□□ 2.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ubl4bQ9CQ84 188 aa31.84■■■□□ 2.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efcab5A0JP43 1406 aa31.84■■■□□ 2.69
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CntlnA2AM05 1397 aa31.81■■■□□ 2.68
Trafd1-201ENSMUST00000042312 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa31.79■■■□□ 2.68
Trafd1-201ENSMUST00000042312 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Duox2A2AQ99 1517 aa31.76■■■□□ 2.67
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aplp2Q06335 707 aa31.71■■■□□ 2.67
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa31.69■■■□□ 2.66
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fyco1Q8VDC1 1437 aa31.65■■■□□ 2.66
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Peg3Q3URU2 1571 aa31.64■■■□□ 2.66
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm38655A0A286YDK6 273 aa31.62■■■□□ 2.65
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aebp1Q640N1 1128 aa31.61■■■□□ 2.65
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SynmQ70IV5 1561 aa31.59■■■□□ 2.65
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Samd9lQ69Z37 1561 aa31.59■■■□□ 2.65
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fhad1A6PWD2 1420 aa31.57■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa31.56■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpap1Q80TE0 1409 aa31.53■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rad54l2Q99NG0 1466 aa31.51■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mia2Q91ZV0 1396 aa31.51■■■□□ 2.64
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa31.51■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 UacaQ8CGB3 1411 aa31.48■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vps8Q0P5W1 1427 aa31.48■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam135aQ6NS59 1506 aa31.47■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip2Q9QUK4 1447 aa31.47■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa31.46■■■□□ 2.63
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccer2J3QPU5 274 aa31.44■■■□□ 2.62
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A2mQ6GQT1 1474 aa31.38■■■□□ 2.61
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crocc2F6XLV1 1638 aa31.37■■■□□ 2.61
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenpbP27790 599 aa31.37■■■□□ 2.61
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chic2Q9D9G3 165 aa31.31■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm13697A2AK42 830 aa31.3■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccnb3Q810T2 1396 aa31.29■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ube2uB1AUC4 352 aa31.28■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa31.27■■■□□ 2.6
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnnt3Q9QZ47 272 aa31.24■■■□□ 2.59
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pla2r1Q62028 1487 aa31.22■■■□□ 2.59
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpatch8A2A6A1 1505 aa31.2■■■□□ 2.59
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa31.18■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CadpsQ80TJ1 1355 aa31.17■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif21aQ9QXL2 1672 aa31.16■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf710Q3U288 666 aa31.15■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca5Q8K448 1642 aa31.14■■■□□ 2.58
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip5Q9R016 1403 aa31.13■■■□□ 2.57
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cul7Q8VE73 1689 aa31.12■■■□□ 2.57
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif27Q7M6Z4 1394 aa31.12■■■□□ 2.57
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Magi3Q9EQJ9 1476 aa31.1■■■□□ 2.57
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Camsap2Q8C1B1 1461 aa31.09■■■□□ 2.57
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NexmifQ5DTT1 1515 aa31.06■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BC005561E9Q5E2 1589 aa31.05■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncoa2Q61026 1462 aa31.04■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stra8P70278 393 aa31.04■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gcc2Q8CHG3 1679 aa31.02■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 WizO88286 1684 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fhod3Q76LL6 1578 aa31.01■■■□□ 2.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grin2aP35436 1464 aa31■■■□□ 2.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mphosph9A6H5Y1 991 aa30.98■■■□□ 2.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plb1Q3TTY0 1478 aa30.92■■■□□ 2.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrc2Q64449 1479 aa30.91■■■□□ 2.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adamts12Q811B3 1600 aa30.91■■■□□ 2.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cabp1Q9JLK7 227 aa30.9■■■□□ 2.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Disp1Q3TDN0 1521 aa30.87■■■□□ 2.53
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PxdnQ3UQ28 1475 aa30.86■■■□□ 2.53
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Soga1E1U8D0 1418 aa30.86■■■□□ 2.53
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp644E9QA22 1323 aa30.84■■■□□ 2.53
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setbp1Q9Z180 1582 aa30.83■■■□□ 2.53
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc24a1Q91WD8 1130 aa30.82■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rfx7F8VPJ6 1459 aa30.81■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Setd1bQ8CFT2 1985 aa30.81■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mug1P28665 1476 aa30.81■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pprc1Q6NZN1 1644 aa30.8■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc5Q9R1X5 1436 aa30.79■■■□□ 2.52
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 WrnO09053 1401 aa30.78■■■□□ 2.52
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ift140E9PY46 1464 aa30.77■■■□□ 2.52
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