RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV10A0A0B4J240 114 aa16.57■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 FHL2Q14192 279 aa16.57■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 AP1S3Q96PC3 154 aa16.57■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 EVI2AP22794 236 aa16.56■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 FAM74A4Q5TZK3 123 aa16.56■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.56■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 F5H768 121 aa16.56■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 ZFP2Q6ZN57 461 aa16.55■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 STARD9Q9P2P6 4700 aa16.55■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 ATP6V1G1O75348 118 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 TRGC1P0CF51 173 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00315P59091 139 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 RIGQ13278 110 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 Q6ZSN1 163 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 MUC7Q8TAX7 377 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa16.54■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa16.53■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GXF2 115 aa16.53■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 RHODO00212 210 aa16.52■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.52■□□□□ 0.24
PDSS1-201ENST00000376215 CIDEAO60543 219 aa16.52■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 CAMPP49913 170 aa16.51■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 ZFAND6Q6FIF0 208 aa16.51■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 BTF3L4Q96K17 158 aa16.51■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TENM2Q9NT68 2774 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 SMIM17P0DL12 118 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 S100PP25815 95 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 HHLA3Q9XRX5 114 aa16.5■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa16.49■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 CRYBA4P53673 196 aa16.49■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 HBBP68871 147 aa16.49■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 VSIG2Q96IQ7 327 aa16.49■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 PRO0255Q9UI72 69 aa16.49■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 A0A0J9YY99 117 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 A0A1B0GW15 77 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 NUPR2A6NF83 97 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 MGPP08493 103 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 ZNF56Q15929 161 aa16.48■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.47■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.47■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 RAB4BP61018 213 aa16.46■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 ELOBQ15370 118 aa16.46■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 Q9UF83 564 aa16.46■□□□□ 0.23
PDSS1-201ENST00000376215 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 IGLL5B9A064 214 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 F5H697 171 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 PAX4O43316 350 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 SLAQ13239 276 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 GATD1Q8NB37 220 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 AMN1Q8IY45 258 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 RNF185Q96GF1 192 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 YPEL4Q96NS1 127 aa16.45■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 S100A8P05109 93 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 P0DMU3 169 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 FAM231AP0DMU4 169 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 FAM231CP0DMU5 169 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 S100A1P23297 94 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.44■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 K7EQD1 137 aa16.43■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 FAM210BQ96KR6 192 aa16.43■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.43■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa16.42■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 RAB4AP20338 218 aa16.42■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 H3BNG1 76 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 SCO1O75880 301 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 RHOHQ15669 191 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 RASL11AQ6T310 242 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 M0QY20 66 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 GYPEP15421 78 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 CASC10Q5T4H9 136 aa16.41■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16.4■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 C3orf84H3BNL1 204 aa16.4■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 PRADC1Q9BSG0 188 aa16.4■□□□□ 0.22
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.39■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 GAS8-AS1O95177 125 aa16.38■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 A0A096LPF7 62 aa16.37■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 APLNQ9ULZ1 77 aa16.37■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 NUDT3O95989 172 aa16.37■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa16.37■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa16.36■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.36■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.36■□□□□ 0.21
PDSS1-201ENST00000376215 GAGE12JA6NER3 117 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 381.7 ms