RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	VPS34	P22543	875 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	MRPL7	P36519	292 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	PPE1	P38796	400 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	YDL183C	P48569	320 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	TRS23	Q03784	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	SLX4	Q12098	748 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YLR224W	YLR224W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TOM20	P35180	183 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	STL1	P39932	569 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	THI6	P41835	540 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MRK1	P50873	501 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MNT2	P53059	558 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YAP7	Q08182	245 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PSF3	Q12146	194 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ICT1	Q12385	394 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	STE4	P18851	423 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	HOP1	P20050	605 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	CWH43	P25618	953 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	EAF5	P39995	279 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	LRO1	P40345	661 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YIP4	P53093	235 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MFM1	Q02783	413 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RIM13	Q03792	727 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TPK2	P06245	380 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ERG11	P10614	530 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SEC12	P11655	471 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YJL193W	P39542	402 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	GLO1	P50107	326 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MDR1	P53258	950 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	FMP30	Q02883	468 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ARR3	Q06598	404 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	VPS33	P20795	691 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PHO3	P24031	467 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TMT1	P32643	299 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ORC2	P32833	620 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	LOT5	P34234	306 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PIH1	P38768	344 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TAX4	P47030	604 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PEX8	P53248	589 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	BUD17	P53727	317 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YNL034W	P53963	612 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YNL018C	P53976	612 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YDL073W	Q07454	984 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	NUP1	P20676	1076 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	GRX7	P38068	203 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RIM4	P38741	713 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YIL092W	P40497	633 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	MAD2	P40958	196 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	YNR071C	P53757	342 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ARG7	Q04728	441 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	HOS1	Q12214	470 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	URA3	P03962	267 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	PCK1	P10963	549 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ARG1	P22768	420 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	CNE1	P27825	502 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	DSS4	P32601	143 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SDS22	P36047	338 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TAF5	P38129	798 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SAW1	P39735	261 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	CPR8	P53728	308 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TGL2	P54857	326 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	USA1	Q03714	838 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	SND1	Q04007	877 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	TGS1	Q12052	315 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	NUR1	Q12066	484 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YLR224W	YLR224W	NIC96	P34077	839 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	CCL1	P37366	393 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	YGL117W	P53133	265 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	ULA1	Q12059	462 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	TGL1	P34163	548 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	YLF2	P38746	405 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	XBP1	P40489	647 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YLR224W	YLR224W	GSM1	P42950	618 aa		3.45	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms