RNA–Protein interactions for RNA: YHR180W

YHR180W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHR180W, Length 492 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR180W	YHR180W	USV1	Q12132	391 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	MHP1	P43638	1398 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SWI6	P09959	803 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	ABF1	P14164	731 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SEC15	P22224	910 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	KIN82	P25341	720 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	GRX4	P32642	244 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YKU70	P32807	602 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	GLG1	P36143	616 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	BRN1	P38170	754 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	TAP42	Q04372	366 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	MDM10	P18409	493 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YIL166C	P40445	542 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	BIT61	P47041	543 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	TAH11	P47112	604 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	NTH1	P32356	751 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YPT7	P32939	208 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SET3	P36124	751 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YIL077C	P40508	320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	HFD1	Q04458	532 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SUT2	Q12286	268 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	UBS1	P38290	277 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	MPS3	P47069	682 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RFX1	P48743	811 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YGR237C	P50089	785 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YGL081W	P53156	320 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YGR151C	P53287	111 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	ECM9	Q02202	377 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	PPN1	Q04119	674 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YPS7	Q06325	596 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	HIM1	Q06674	414 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	NYV1	Q12255	253 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	IME1	P21190	360 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	FUB1	P25659	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	SEC65	P29478	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	OAF3	P36023	863 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	GMH1	P36125	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	CTP1	P38152	299 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	PFF1	P38244	976 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	COS111	P38308	924 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	HXT7	P39004	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	PXA1	P41909	870 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	GPG1	P53130	126 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YFT2	Q06676	274 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	CTI6	Q08923	506 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	APM4	Q99186	491 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RIM15	P43565	1770 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YHR180W	YHR180W	RPN13	O13563	156 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	SPO11	P23179	398 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	KCC4	P25389	1037 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	PPZ2	P33329	710 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	DID4	P36108	232 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	KHA1	P40309	873 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	SPO1	P53541	631 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	YHM2	Q04013	314 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	AFT2	Q08957	416 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	HFI1	Q12060	488 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	DUN1	P39009	513 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	BUD8	P41698	603 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
YHR180W	YHR180W	IES1	P43579	692 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	DSD1	P53095	428 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	STP4	Q07351	490 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	ADY2	P25613	283 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YHR180W	YHR180W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74

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