RNA–Protein interactions for RNA: YGR104C

SRB5, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene SRB5, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRB5	YGR104C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	DMC1	P25453	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	DBF20	P32328	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PLC1	P32383	869 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	EUG1	P32474	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	RIM4	P38741	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YHR131C	P38835	850 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SPC72	P39723	622 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PXA1	P41909	870 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	AGX1	P43567	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ALG2	P43636	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	GAD1	Q04792	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	OPY2	Q06810	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MDM36	Q06820	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	REX3	Q12090	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	NFI1	Q12216	726 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	HMG1	P12683	1054 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	RAD16	P31244	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TFB1	P32776	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	LTV1	P34078	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MIC60	P36112	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	CTM1	P38818	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SPT8	P38915	602 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SHR5	P41912	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	GYP8	P43570	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	IML2	P47031	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YJL055W	P47044	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	GPG1	P53130	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YNL050C	P53952	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	UME1	Q03010	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	HOT1	Q03213	719 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ARP9	Q05123	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MRP7	P12687	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ACP1	P32463	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TFC4	P33339	1025 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	COY1	P34237	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PCL5	P38794	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TEL2	P53038	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YBP2	P53169	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	FDC1	Q03034	503 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MLC2	Q06580	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	THI73	Q07904	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	DIF1	O13577	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	KIN3	P22209	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	NTG1	P31378	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ORC2	P32833	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YKL133C	P36066	463 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	EFM2	P38347	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YHL041W	P38730	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	REV7	P38927	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	BAP3	P41815	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YGR153W	P48238	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	ZIP2	P53061	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MEP3	P53390	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SEC5	P89102	971 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MLH2	Q07980	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	IRC13	Q08630	104 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TRE2	Q08693	809 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	CAN1	P04817	590 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	PPQ1	P32945	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	UBS1	P38290	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	TDP1	P38319	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YJL070C	P40361	888 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	MDE1	P47095	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	UBC11	P52492	156 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	NUP84	P52891	726 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRB5	YGR104C	YNL193W	P53870	558 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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