RNA–Protein interactions for RNA: YGL103W

RPL28, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L28, yeast

Gene RPL28, Length 450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL28	YGL103W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YRR1	Q12172	810 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MSH5	Q12175	901 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	STB3	Q12427	513 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
RPL28	YGL103W	GPA2	P10823	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SAN1	P22470	610 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CNA1	P23287	553 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CLB2	P24869	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CDC20	P26309	610 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TMT1	P32643	299 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RIB7	P33312	244 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	STV1	P37296	890 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YBL036C	P38197	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	GIP1	P38229	639 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	PHO89	P38361	574 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	APE4	P38821	490 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	EAF5	P39995	279 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CAB2	P40506	365 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YJL045W	P47052	634 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	VTC4	P47075	721 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ORC5	P50874	479 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MTC3	P53077	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	NUT1	P53114	1132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CUL3	P53202	744 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	KRE28	Q04431	385 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SPC2	Q04969	178 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YLR455W	Q06188	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SHS1	Q07657	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	IES4	Q08561	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	GET4	Q12125	312 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	HRT3	Q12347	344 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	IMA3	P0CW40	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	IMA4	P0CW41	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	VAC17	P25591	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ADY2	P25613	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	URA10	P30402	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TFC1	P32367	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	PEP12	P32854	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	CYM1	P32898	989 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MRP8	P35719	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	KDX1	P36005	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ERT1	P38140	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SWC5	P38326	303 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	BZZ1	P38822	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MGS1	P40151	587 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RRN7	P40992	514 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SNZ3	P43545	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	FMP32	P43557	207 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	POL31	P46957	487 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TAH11	P47112	604 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RPA14	P50106	137 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TEL2	P53038	688 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RCF2	P53721	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SNZ2	P53824	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ASI2	P53895	289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YKR005C	Q02203	525 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YMR209C	Q03648	457 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TRS130	Q03660	1102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	RKM2	Q03942	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SPH1	Q06160	661 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	ASA1	Q06822	443 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	IMA2	Q08295	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MCH5	Q08777	521 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	YLL056C	Q12177	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	LDB17	Q12342	491 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	EMP46	Q12396	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	GIS3	Q12418	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	STE6	P12866	1290 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL28	YGL103W	TGL1	P34163	548 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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