RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C ATP23P53722 227 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C LAM4P38800 1345 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C FKS3Q04952 1785 aa2.81□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YRF1-4O13559 1382 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C SLX1P38324 304 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C PMT6P42934 759 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YFL052WP43551 465 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RPN11P43588 306 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RSC8P43609 557 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C DSD1P53095 428 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ADE16P54113 591 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C IOC4Q04213 475 aa2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C SNF2P22082 1703 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C EDE1P34216 1381 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MCD4P36051 919 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YKR075CP36155 307 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NMD5P46970 1048 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MPS3P47069 682 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C PIP2P52960 996 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YDR179W-AQ03983 463 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C RKI1Q12189 258 aa2.79□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YRF1-3P0CX14 1859 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YRF1-7P0CX15 1859 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YRF1-6P53819 1859 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NUP145P49687 1317 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C OSM1P21375 501 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MIH1P23748 554 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MRPL9P31334 269 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MTC2P34246 357 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YKR051WP36142 418 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NPR2P39923 615 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YNL195CP40168 261 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C KHA1P40309 873 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C MPP10P47083 593 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YGL117WP53133 265 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NPY1P53164 384 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C VPS36Q06696 566 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C YDL144CQ07589 356 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ECM3Q99252 613 aa2.78□□□□□ -1.96
GCN4YEL009C ERR1P0CX10 437 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C ERR2P0CX11 437 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C GAL11P19659 1081 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C PRD1P25375 712 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C AAD3P25612 363 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C PEX6P33760 1030 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C GDH3P39708 457 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MAL11P53048 616 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C COX18P53239 316 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C CPR8P53728 308 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C LEE1Q02799 301 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C NDD1Q08887 554 aa2.77□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RPP0P05317 312 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C APD1P38281 316 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C SNF12P53628 566 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YNL050CP53952 270 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C ARP4P80428 489 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C AAT1Q01802 451 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C UFO1Q04511 668 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MRPL1Q04599 285 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RTT109Q07794 436 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C FRE7Q12333 620 aa2.76□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C CDC9P04819 755 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C SUI2P20459 304 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C VBA3P25594 458 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C NTH1P32356 751 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YKR018CP36114 725 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RPN10P38886 268 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MAM1P40065 302 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C VPS27P40343 622 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RFX1P48743 811 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RMT2Q03305 412 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C NSE3Q05541 303 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C CDC45Q08032 650 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C ALE1Q08548 619 aa2.75□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C PMA2P19657 947 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C MET30P39014 640 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C YJL049WP47048 450 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C PCL10P53124 433 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C DIP5P53388 608 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C BUG1Q12191 341 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C RIM15P43565 1770 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C LYS2P07702 1392 aa2.74□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C STO1P34160 861 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C HSL7P38274 827 aa2.73□□□□□ -1.97
GCN4YEL009C CAF16P43569 289 aa2.73□□□□□ -1.97
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