RNA–Protein interactions for RNA: YLR368W

MDM30, Transcript of F-box component of an SCF ubiquitin protein ligase complex, yeast

Gene MDM30, Length 1,797 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM30	YLR368W	SIF2	P38262	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YHL008C	P38750	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DSS1	P39112	969 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ECM1	P39715	212 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YEL068C	P39977	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LTP1	P40347	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YIL077C	P40508	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YRB2	P40517	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NAS2	P40555	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PHB1	P40961	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPR3	P41901	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	AAD14	P42884	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VPS53	P47061	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ASE1	P50275	885 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RTA1	P53047	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SPC2	Q04969	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	VAC14	Q06708	880 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TRM8	Q12009	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SEC39	Q12745	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	ARG80	P07249	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CDC34	P14682	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MRPL8	P22353	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CDC15	P27636	974 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MRP8	P35719	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NUP133	P36161	1157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	POP7	P38291	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PIB2	P53191	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YGR053C	P53234	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YNR061C	P53747	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DSE4	P53753	1117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RMT2	Q03305	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PDR8	Q06149	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SRN2	Q99176	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	STE13	P33894	931 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SEG2	P34250	1132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PRM9	P39551	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	MBP1	P39678	833 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NDC80	P40460	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RMD8	P43620	662 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SIW14	P53965	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	GMC2	Q06201	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PEX19	Q07418	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	DIN7	Q12086	430 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	WTM2	Q12206	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	RBD2	Q12270	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM30	YLR368W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	SFL1	P20134	766 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	YBR197C	P38306	217 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	PIC2	P40035	300 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	ATF1	P40353	525 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	APS3	P47064	194 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	SSN8	P47821	323 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	MAL11	P53048	616 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	SFB2	P53953	876 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	UFD2	P54860	961 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	SSL2	Q00578	843 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	CAB1	Q04430	367 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	ECM18	Q04623	453 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	RSF1	Q05043	376 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	RTT103	Q05543	409 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	CIA1	Q05583	330 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	TOS4	Q06266	489 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	ATG17	Q06410	417 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	GIS3	Q12418	502 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM30	YLR368W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.7 ms