RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR078WYKR078W YAP7Q08182 245 aa3.47□□□□□ -1.85
YKR078WYKR078W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YKR078WYKR078W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W SPO1P53541 631 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W NUP1P20676 1076 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PRE4P30657 266 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HXT7P39004 570 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CPR8P53728 308 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W TRS23Q03784 219 aa3.46□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W ADR1P07248 1323 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W APN1P22936 367 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
YKR078WYKR078W AAD3P25612 363 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CDS1P38221 457 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86 RIP-Chip
YKR078WYKR078W THI6P41835 540 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W FDC1Q03034 503 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PPN1Q04119 674 aa3.45□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PTP1P25044 335 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W SEC65P29478 273 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PPE1P38796 400 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W LTP1P40347 161 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W XBP1P40489 647 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W IES1P43579 692 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HLJ1P48353 224 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W TAF4P50105 388 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W ECM9Q02202 377 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W THI73Q07904 523 aa3.44□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W TUP1P16649 713 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HOT13P36078 116 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W MRPL7P36519 292 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W DUN1P39009 513 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W FTR1P40088 404 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YGR153WP48238 217 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W SEC5P89102 971 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W TIM50Q02776 476 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W MBR1P23493 339 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W FAT1P38225 669 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W NET1P47035 1189 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PIP2P52960 996 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YIP4P53093 235 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W NSE5Q03718 556 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HFI1Q12060 488 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W ZPS1Q12512 249 aa3.43□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W GLN4P13188 809 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PMA2P19657 947 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CNE1P27825 502 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W OAF3P36023 863 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PIH1P38768 344 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W GAT1P43574 510 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W HLR1Q04429 423 aa3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W RIM4P38741 713 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W PRM2P40534 656 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W MFM1Q02783 413 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YHM2Q04013 314 aa3.41□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W MTC7P32633 139 aa3.4□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YNL018CP53976 612 aa3.4□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W APM4Q99186 491 aa3.4□□□□□ -1.86
YKR078WYKR078W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W CDC26P14724 124 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W VID28P40547 921 aa3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W COQ6P53318 479 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W BUD17P53727 317 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W ARR3Q06598 404 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W YDL073WQ07454 984 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W INO80P53115 1489 aa3.39□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
YKR078WYKR078W DID4P36108 232 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W EHT1P38295 451 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W YHR033WP38690 423 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W PMT3P47190 753 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W YDL183CP48569 320 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W GPG1P53130 126 aa3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YKR078WYKR078W UME1Q03010 460 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 213.3 ms