RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	SWC3	P31376	625 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SLC1	P33333	303 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SEA4	P38164	1038 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	BIT2	P38346	545 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HSM3	P38348	480 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RAD55	P38953	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GCD10	P41814	478 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YJR096W	P47137	282 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MET13	P53128	600 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ALF1	P53904	254 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CIK1	Q01649	594 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ADA2	Q02336	434 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ARA2	Q04212	335 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	COG8	Q04632	607 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PEX15	Q08215	383 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GLO4	Q12320	285 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SWI1	P09547	1314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SEM1	O94742	89 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	FLP1	P03870	423 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SRD1	P09007	221 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
KTR2	YKR061W	MRPL25	P23369	157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	TFB1	P32776	642 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DOM34	P33309	386 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
KTR2	YKR061W	MTH1	P35198	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MIC60	P36112	540 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	VPS45	P38932	577 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PIC2	P40035	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	VHR1	P40522	640 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.68	□□□□□ -1.66	not detected
KTR2	YKR061W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PCL10	P53124	433 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SDH1	Q00711	640 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PEX25	Q02969	394 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RRN5	Q02983	363 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ARP9	Q05123	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GUD1	Q07729	489 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RAD18	P10862	487 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	KAR3	P17119	729 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SFL1	P20134	766 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DAL7	P21826	554 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PRP28	P23394	588 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MNE1	P24720	663 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YCR015C	P25616	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	KTR2	P33550	425 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SQT1	P35184	431 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	LRG1	P35688	1017 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MCD4	P36051	919 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DID4	P36108	232 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YLF2	P38746	405 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YEL068C	P39977	110 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YJL068C	P40363	299 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	UBP7	P40453	1071 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SMK1	P41808	388 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	AGX1	P43567	385 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	POL31	P46957	487 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MAD3	P47074	515 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	NUP84	P52891	726 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	NNF2	P53253	936 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YAP1802	P53309	568 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	UBP16	Q02863	499 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YER152C	P10356	443 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	MET8	P15807	274 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PCL2	P25693	308 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	NGG1	P32494	702 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	YKU70	P32807	602 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ATG19	P35193	415 aa		4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.8 ms