RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	IME1	P21190	360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PPE1	P38796	400 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	TAF4	P50105	388 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	SPO1	P53541	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	TRS23	Q03784	219 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	DID4	P36108	232 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YHR033W	P38690	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HXT7	P39004	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MIT1	P40002	666 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YGR237C	P50089	785 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	IOC4	Q04213	475 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HOF1	Q05080	669 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PRE4	P30657	266 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YMC1	P32331	307 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	OAF3	P36023	863 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	HFI1	Q12060	488 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	TPK2	P06245	380 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ERG11	P10614	530 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	DGR2	P32330	852 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	FAT1	P38225	669 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	PIH1	P38768	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
SFT1	YKL006C-A	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	SNF12	P53628	566 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	MFM1	Q02783	413 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	FDC1	Q03034	503 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	NSE5	Q03718	556 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	ULA1	Q12059	462 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SFT1	YKL006C-A	STE4	P18851	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	RIM4	P38741	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	FTR1	P40088	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	VID28	P40547	921 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	IES1	P43579	692 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	ATG36	P46983	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	OSW1	Q08692	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	AIM41	Q12032	185 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	TUP1	P16649	713 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YEL025C	P39991	1188 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	GPG1	P53130	126 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	TIM50	Q02776	476 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	AFT2	Q08957	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	NUP1	P20676	1076 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	CDS1	P38221	457 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	PRM2	P40534	656 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	TAX4	P47030	604 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	AAD3	P25612	363 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	SNM1	P40993	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YIP4	P53093	235 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YGL117W	P53133	265 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	CPR8	P53728	308 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	RIM13	Q03792	727 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	SEG1	Q04279	960 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	HLR1	Q04429	423 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	ZPS1	Q12512	249 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	APM4	Q99186	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	PTP1	P25044	335 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	MRPL7	P36519	292 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	PEA2	P40091	420 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	ARG7	Q04728	441 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YCG1	Q06680	1035 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	YDL073W	Q07454	984 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	CDC26	P14724	124 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
SFT1	YKL006C-A	CNE1	P27825	502 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	DAL3	P32459	195 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	EHT1	P38295	451 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	RMP1	Q12530	201 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SFT1	YKL006C-A	BRN1	P38170	754 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	XBP1	P40489	647 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	BUD17	P53727	317 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	TGS1	Q12052	315 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	YPR027C	Q12079	277 aa		4.02	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
SFT1	YKL006C-A	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	HMG2	P12684	1045 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	APN1	P22936	367 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	GLO1	P50107	326 aa		4.01	□□□□□ -1.77
SFT1	YKL006C-A	COQ6	P53318	479 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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