RNA–Protein interactions for RNA: YHR213W

YHR213W, Transcript of Pseudogenic fragment with similarity to flocculins, yeastyeast

Gene YHR213W, Length 597 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR213WYHR213W YNL193WP53870 558 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W ARP4P80428 489 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W SEC5P89102 971 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W TRM3Q07527 1436 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W YLR001CQ07895 862 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W ECM3Q99252 613 aa3.91□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W MMS1Q06211 1407 aa3.9□□□□□ -1.78
YHR213WYHR213W PCL2P25693 308 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SEC6P32844 805 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W APL3P38065 1025 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W HLJ1P48353 224 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W GLO1P50107 326 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YDL086WQ07505 273 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W IQG1Q12280 1495 aa3.9□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SFL1P20134 766 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SEC15P22224 910 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W TMT1P32643 299 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W CTP1P38152 299 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YJR039WP47107 1121 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W DNM1P54861 757 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ATG33Q06485 197 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YAP7Q08182 245 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W POM34Q12445 299 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PDR10P51533 1564 aa3.89□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W BUD3P25558 1636 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W CAT8P39113 1433 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W DOP1Q03921 1698 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W HMG1P12683 1054 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SAT4P25333 603 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MNN4P36044 1178 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MAL31P38156 614 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W LTP1P40347 161 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MPS3P47069 682 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YGL081WP53156 320 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W RIM13Q03792 727 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W OSW1Q08692 278 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W GIN4Q12263 1142 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W TY3B-GQ99315 1547 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W NUP145P49687 1317 aa3.88□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W KIN82P25341 720 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YMC2P38087 329 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MGS1P40151 587 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YNL195CP40168 261 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W KHA1P40309 873 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PMT3P47190 753 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W AIM14P53109 570 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MET13P53128 600 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W GUD1Q07729 489 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W DNF2Q12675 1612 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YBT1P32386 1661 aa3.87□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YKR075CP36155 307 aa3.86□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W FMP30Q02883 468 aa3.86□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W THI73Q07904 523 aa3.86□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PGK1P00560 416 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W STE12P13574 688 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PET127P32606 800 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YHR202WP38887 602 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YIL077CP40508 320 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PMT6P42934 759 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ATG36P46983 293 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W BFA1P47113 574 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W RFX1P48743 811 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W VHS3Q08438 674 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W RKI1Q12189 258 aa3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PHO5P00635 467 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W ERG11P10614 530 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.79not detected
YHR213WYHR213W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W PTP1P25044 335 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W MIT1P40002 666 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W BIT61P47041 543 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W NMA2P53204 395 aa3.84□□□□□ -1.79
YHR213WYHR213W UME1Q03010 460 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms