RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G HIR2P32480 875 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G NIP1P32497 812 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ATO2P32907 282 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G BCK2P33306 851 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TSA1P34760 196 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GEF1P37020 779 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GRX7P38068 203 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ATG12P38316 186 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G NDT80P38830 627 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G FET3P38993 636 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SAP1P39955 897 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YEL020CP39994 560 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G EAF5P39995 279 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ZRG8P40021 1076 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SPO73P40031 143 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VFA1P40080 203 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GID8P40208 455 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TOK1P40310 691 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G FYV8P46949 817 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G POL31P46957 487 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YJR039WP47107 1121 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G NPA3P47122 385 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VEL1P53058 206 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SNO2P53823 222 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GAS3Q03655 524 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RSF1Q05043 376 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G STP3Q05937 343 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SUE1Q06524 206 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GYP1Q08484 637 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G MCA1Q08601 432 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SRO7Q12038 1033 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RCN2Q12044 265 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SPO21Q12411 609 aa0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RVB2Q12464 471 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL15AP05748 204 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YJL197C-AP0C5P0 93 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G PYC1P11154 1178 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G HMG1P12683 1054 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SPT15P13393 240 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G OM45P16547 393 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G URA4P20051 364 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ELO2P25358 347 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VAC17P25591 423 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR102CP25608 368 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YJU3P28321 313 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC20P28791 383 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SIN4P32259 974 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G NTH1P32356 751 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G CBF2P32504 956 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TMT1P32643 299 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G UGA4P32837 571 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VBA5P36172 582 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ICS2P38284 255 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YBR287WP38355 427 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SMF1P38925 575 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G DUN1P39009 513 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TGL3P40308 642 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SER33P40510 469 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G DAK2P43550 591 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G HXT10P43581 546 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G PCL10P53124 433 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ZPR1P53303 486 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ZRG17P53735 605 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VAC7P53950 1165 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ALG11P53954 548 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G UFD2P54860 961 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS30Q02948 557 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS16Q03308 798 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G STE20Q03497 939 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G HRD3Q05787 833 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G LCB5Q06147 687 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR306CQ06640 478 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TFB4Q12004 338 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TAF10Q12030 206 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G GET3Q12154 354 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G NSI1Q12457 570 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YPR015CQ12531 247 aa0.89□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YPT1P01123 206 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G COX4P04037 155 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TOM70P07213 617 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RAD2P07276 1031 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G MCM1P11746 286 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G MRP7P12687 371 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS3P23643 1011 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G RIT1P23796 513 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YCR006CP25350 157 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G AGP1P25376 633 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G PWP2P25635 923 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TPD3P31383 635 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G MET4P32389 672 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS35P34110 944 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G SIF2P38262 535 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G TDA11P38854 504 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G FLO5P38894 1075 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G ILV3P39522 585 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G MAM1P40065 302 aa0.88□□□□□ -2.27
tF(GAA)GtF(GAA)G YER186CP40101 306 aa0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.3 ms