RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PIP2	P52960	996 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	OMS1	Q06668	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	AIM39	Q08223	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	TRM13	Q12383	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SYC1	YOR179C	SEC15	P22224	910 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YKL133C	P36066	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HOS4	P40480	1083 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	TAF4	P50105	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PPN1	Q04119	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PEX1	P24004	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	ERG4	P25340	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	KIN82	P25341	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PTP2	P29461	750 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	FMO1	P38866	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	NUP60	P39705	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YEL076C	P39971	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YIL092W	P40497	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	BAP3	P41815	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	IRC5	P43610	853 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	NSE5	Q03718	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	MLC2	Q06580	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	IRC13	Q08630	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	FRE5	Q08908	694 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	NUR1	Q12066	484 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	POM34	Q12445	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YPT7	P32939	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	RIM4	P38741	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	BCD1	P38772	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	THI22	Q06490	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	NTO1	Q12311	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PHO3	P24031	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	KTR4	P38131	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	SAW1	P39735	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	STL1	P39932	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YIL077C	P40508	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	HIS6	P40545	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YJL163C	P46996	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	SPO1	P53541	631 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	RNT1	Q02555	471 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYC1	YOR179C	PIF1	P07271	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	ALG7	P07286	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PRE4	P30657	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	SUL1	P38359	859 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PRM2	P40534	656 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	ASK10	P48361	1146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	UBC11	P52492	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	UBX4	P54730	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	ADY4	Q05955	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PSF3	Q12146	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	BCS1	P32839	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	COS111	P38308	924 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	SFB3	P38810	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	REV7	P38927	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PIG2	P40187	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	VPS5	Q92331	675 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	HMG2	P12684	1045 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	HOP1	P20050	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	MTC7	P32633	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	SDS22	P36047	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
SYC1	YOR179C	FMP52	P40008	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	RFX1	P48743	811 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	MNT2	P53059	558 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	YFT2	Q06676	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	TUP1	P16649	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SYC1	YOR179C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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