RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	APM2	P38700	605 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TCB2	P48231	1178 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	RIM8	P53179	542 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	UFO1	Q04511	668 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	APC5	Q08683	685 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TPK1	P06244	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	HAP2	P06774	265 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	KAR3	P17119	729 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	AEP2	P22136	580 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SLA2	P33338	968 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SWC5	P38326	303 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	VPS54	Q12071	889 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YHR202W	P38887	602 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	MIC19	P43594	170 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	EMP46	Q12396	444 aa		11.43	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	PCA1	P38360	1216 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	ERP2	P39704	215 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SPC98	P53540	846 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TAF9	Q05027	157 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	THI7	Q05998	598 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	MDM38	Q08179	573 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TAF10	Q12030	206 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	VPS5	Q92331	675 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	SRB2	P34162	210 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	XDJ1	P39102	459 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YEL023C	P39992	682 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	FIR1	P40020	876 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	ARG2	P40360	574 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	TMA108	P40462	946 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	PFD1	P46988	109 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YML6	P51998	286 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	CDC55	Q00362	526 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		11.41	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	CIT2	P08679	460 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	CCL1	P37366	393 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	HMT1	P38074	348 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	RAD55	P38953	406 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	LYS9	P38999	446 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YMR134W	P40207	237 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YIL054W	P40524	105 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	ASG7	P46993	209 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	GPM2	Q12008	311 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	YRR1	Q12172	810 aa		11.4	□□□□□ -0.58
DDR2	YOL052C-A	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	TKL2	P33315	681 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	MSG5	P38590	489 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	KHA1	P40309	873 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	OPT1	P40897	799 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YNL320W	P42840	284 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	NMD5	P46970	1048 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	HLJ1	P48353	224 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	SLG1	P54867	378 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	FMP25	Q08023	583 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YDR018C	Q12185	396 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	PEP5	P12868	1029 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	APN2	P38207	520 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YJR039W	P47107	1121 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YNL011C	P53980	444 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YDL073W	Q07454	984 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	UBR2	Q07963	1872 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YML002W	P0CF17	737 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	SPO16	P17122	198 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	ADK2	P26364	225 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	MET4	P32389	672 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YBR284W	P38150	797 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	VHC1	P38329	1120 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RGD1	P38339	666 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	INA22	P40576	216 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	SAP185	P40856	1058 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	YPL062W	Q02781	134 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	STE23	Q06010	1027 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	THI20	Q08224	551 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DDR2	YOL052C-A	RAD10	P06838	210 aa		11.36	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.3 ms