RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	ASG1	P40467	964 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	YIR016W	P40572	265 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	MAF1	P41910	395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	LSB6	P42951	607 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	STU2	P46675	888 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	ASG7	P46993	209 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	ATG16	Q03818	150 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	NBP2	Q12163	236 aa		6.25	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PEX2	P32800	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	CDC27	P38042	758 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SPC72	P39723	622 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SEC9	P40357	651 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	TMA108	P40462	946 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
CIN4	YMR138W	KAP114	P53067	1004 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	YNL108C	P53929	270 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	AIM32	Q04689	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	TAF9	Q05027	157 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PIG1	Q06216	648 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
CIN4	YMR138W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	MDM38	Q08179	573 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	LCB4	Q12246	624 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	HRT3	Q12347	344 aa		6.24	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SPE1	P08432	466 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	MAS1	P10507	462 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	HMG2	P12684	1045 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	RGR1	P19263	1082 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SFL1	P20134	766 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SRB4	P32569	687 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	RRN6	P32786	894 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	HIS2	P38635	335 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	ERP2	P39704	215 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PRK1	P40494	810 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	GUF1	P46943	645 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PRM6	Q04705	352 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	YDR344C	Q05510	147 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	VAC14	Q06708	880 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	AIM39	Q08223	395 aa		6.23	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	CCP1	P00431	361 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	APE1	P14904	514 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	RAD16	P31244	790 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	YBR053C	P38235	358 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SWC5	P38326	303 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SFB3	P38810	929 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	LYS9	P38999	446 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	TMN3	P40071	706 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PFD1	P46988	109 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	HER2	Q03557	464 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	SML1	Q04964	104 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	HRD3	Q05787	833 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	BSP1	Q06604	576 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	VPS5	Q92331	675 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CIN4	YMR138W	PET111	P08468	800 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	STE11	P23561	717 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	GYP6	P32806	458 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	SRB2	P34162	210 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YBR056W	P38081	501 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	ECM13	P38195	257 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YBR225W	P38321	900 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	MMS21	P38632	267 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YHR131C	P38835	850 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	CAJ1	P39101	391 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	MOB1	P40484	314 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	OSW7	P43611	510 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	MRX6	P48564	524 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YLR001C	Q07895	862 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	DDC1	Q08949	612 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	DAP1	Q12091	152 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	EMP46	Q12396	444 aa		6.21	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YLR462W	O13556	202 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	PEX1	P24004	1043 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	COQ8	P27697	501 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	DBF4	P32325	704 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	RRT2	P38332	387 aa		6.2	□□□□□ -1.42
CIN4	YMR138W	YHL049C	P38722	271 aa		6.2	□□□□□ -1.42

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