RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W SPC72P39723 622 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YNL195CP40168 261 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PXA1P41909 870 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CTH1P47976 325 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W TAF4P50105 388 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NSE5Q03718 556 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ENT2Q05785 613 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MCM21Q06675 368 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W VPS36Q06696 566 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PEX19Q07418 342 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NPC2Q12408 173 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W VPS5Q92331 675 aa5.39□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YHR112CP38716 378 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MEF2P39677 819 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ECM1P39715 212 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NOC2P39744 710 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W IMA5P40884 581 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W BUD8P41698 603 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MNT2P53059 558 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W VPS62P53285 467 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NRG1Q03125 231 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PPN1Q04119 674 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YMR018WQ04364 514 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RXT3Q07458 294 aa5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ERG20P08524 352 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CDC6P09119 513 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W GFA1P14742 717 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MNT3P40549 630 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MAD2P40958 196 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W DUS4Q06063 367 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W OPY2Q06810 360 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RRI2Q12348 645 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YOL087CQ99247 1116 aa5.37□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RNR1P21524 888 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CHS3P29465 1165 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RPP1P38786 293 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W SMK1P41808 388 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YAP6Q03935 383 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W DIN7Q12086 430 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ECM3Q99252 613 aa5.36□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PHO5P00635 467 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RER1P25560 188 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W BIT61P47041 543 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CPR6P53691 371 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ARC35P53731 342 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YNR071CP53757 342 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MRPL22P53881 309 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MRPL13Q02204 264 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W GCN5Q03330 439 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W GAD1Q04792 585 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W BRE4Q07660 1125 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W TGL5Q12043 749 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W HOS1Q12214 470 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W TRM11Q12463 433 aa5.35□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NUC1P08466 329 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MCM3P24279 971 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CAD1P24813 409 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ERG6P25087 383 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CWH43P25618 953 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.34□□□□□ -1.55not detected
YKR047WYKR047W YPT7P32939 208 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W XRS2P33301 854 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RRN3P36070 627 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W YLF2P38746 405 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W STT3P39007 718 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W CCT3P39077 534 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W RAD26P40352 1085 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W PEF1P53238 335 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W MEP3P53390 489 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W SPO1P53541 631 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W TEX1P53851 422 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W ATG11Q12527 1178 aa5.34□□□□□ -1.55
YKR047WYKR047W URA3P03962 267 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W HMG2P12684 1045 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W POL3P15436 1097 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SEC15P22224 910 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W KIN82P25341 720 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YCL049CP25577 312 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CDC20P26309 610 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PRE4P30657 266 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MTC7P32633 139 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W LIP5P32875 414 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MPE1P35728 441 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PLB1P39105 664 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.6 ms